上世紀80年代至今，伴隨著我國食用菌快速發展的步伐，全國各省份紛紛成立了食用菌協會。上至中國食用菌協會，下至省級食用菌協會、縣級食用菌協會甚至鄉鎮級食用菌協會。這些食用菌協會均是經民政部登記注冊的具有獨立法人資格的行業社會團體，是由食用菌（含藥用菌）及相關行業的生產、加工、流通企業和科研、教學單位以及專業合作社、地方性行業組織等自愿參加的非營利性社團組織。
不可否認這些食用菌協會對推動中國食用菌產業的發展起了巨大的推動作用，中國食用菌協會2004年經國務院批準，協會代表中國食用菌界加入國際蘑菇學會組織，并被選為副主席國。使中國的食用菌產業走出了國門，走上了世界，并成為全世界食用菌界的關注焦點。
中國是世界上最大的食用菌生產國，產量占世界總產量70%以上。中國食用菌協會作為全國性食用菌行業組織，全面落實科學發展觀，牢固樹立服務意識，努力為會員、為行業、為政府服務。切實維護會員的合法權益，維護公平競爭的市場經濟秩序，維護全行業的整體利益。做好行業自律，充分發揮溝通政府和行業之間的橋梁和紐帶作用，促進我國食用菌行業協調、全面、可持續發展起了十分巨大的作用。
中國食用菌協會及其它省市縣級食用菌協會 對開展行業情況調查和研究工作，協助政府主管部門進行行業管理。制定行規行約，搞好行業自律，維護公平競爭，建立和維護正常的生產、經營和市場秩序。組織行業信息交流，辦好會刊和網站，為會員和行業提供信息和咨詢服務。開展食用菌品種資源、基質資源的考察，加強對野生品種資源和栽培配料的合理開發利用和保護。大力推進食用菌產品深加工,做好行業新技術、新產品的鑒評和菌需品推薦工作。組織技術交流和技術合作。加強國際交流與合作，促進企業開展對外貿易活動。積極發展餐桌經濟，宣傳普及食用菌食用價值、食用方法和科學知識，拓寬市場，引導消費，提高人民的健康水平作了大量卓有成效的工作。正因他們的辛勤努力才有了我國食用菌輝煌的今天。
我國食用菌行業要發展，必須積極爭取各級政府的支持。政府的重視與支持，將在宣傳、資金和政策上起到巨大的導向作用，現在政府要轉變職能，一家一戶又需要組織，協會在這里扮演著一個重要角色，大有作為。協會作為政府與菌農之間承上啟下的紐帶，既能夠及時傳達黨和政府的方針政策，又能夠及時反饋菌農的困難和問題，從而為菌農提供更加優質的服務。同時，協會辦好了，又可以不斷壯大自身實力。不少食用菌協會不遺余力地幫助會員單位積極向農業部、科技部、財政部等部門申請項目資金扶持，推進我國食用菌行業快速發展起到了明顯的作用。
遍布全國各地的食用菌協會在食用菌產業發展中，多數起到了“傳、幫、帶”的作用。大專院校、科研院所與生產單位（或菇農）的密切合作，實行“產學研”相結合，不斷研制、開發出適銷對路的新品種和新產品，增加了競爭能力、促進了行業發展。
雖然食用菌協會在我國食用菌產業發展中起了舉足輕重的作用，但我們也要清醒的看到，目前存在的諸多問題。很多食用菌從業人員對協會的工作不滿意甚至抵觸協會，有人認為協會不作為甚至認為協會就是撈錢的機器，給企業性質差不多。這些問題的出現不能不給協會一個提醒。
少數食用菌協會行業人員自律性差 不能遵循守法、誠信、公正、科學的準則，不能切實執行有關法律、法規和行業規范，不恪守職業道德，不開展合法、公平、正當、有序的行業競爭，影響了食用菌市場的規范運作和整體健康發展。 在食用菌的生產、經營活動中，從業者不能誠信經營，信守合同，恪守承諾，偽造和冒用各類名優或質量認證標志，欺騙消費者，搞虛假宣傳和誤導消費者的活動。企業間存在著不公平、不正當競爭，擾亂正常的市場秩序。同行之間以各種任何形式詆毀、貶低同行企業。 在知識產權方面，沒有倡導自主創新，嚴格遵守國家有關保護專利、商標等知識產權的法律法規。
如今的各地不少食用菌協會產生的背景都與政府行為和經濟體制改革有關，即與政府職能轉變相聯系，它們都得到了各級政府的高度重視。但是，還應看到，“自上而下”型協會帶有較濃的政府色彩，運行績效呈現虎頭蛇尾的趨勢；“自下而上”型協會滿足了企業自身發展的需要，運行績效呈現忽高忽低的趨勢。有些食用菌協會大多是按政府職能工作的需要建立的，工作需要，協會就熱，工作不需要，協會就冷，“自上而下”型協會就是這種典型。
從我了解的情況來看，政府部門很少把職能放權給協會，致使協會有些工作難以操作到位；協會常設機構的專職工作人員嚴重缺乏，沒有相應的職能分工，協會工作得不到細化；協會經費普遍短缺，使很多工作難以開展。這些問題如何解決，關系到協會能否發展壯大，直接影響到協會的形象，甚至影響到整個食用菌產業的健康、科學、有序的發展