生物修復技術為廣東省“再造”藍天碧水創造了條件。廣東省微生物所在廣東的環境治理方面走在前列，早在上世紀五六十年代，社會還未太多關注環境污染之時，我國著名的環保先驅簡浩然就致力于廣東的環保事業。生態環境安全和污染物治理已經成為一個重要的全球性問題，由廣東省微生物所主持的環保科研項目獲國家環保科技進步獎一等獎，是全國省屬科研機構唯一獲得該獎的單位。從當地水污染治理中的老大難問題入手，廣東省微生物所形成了一整套高效經濟地處理含氨和芳香烴類毒害性廢水的微生物新技術。為解決同時含有高濃度氨氮和各種芳香族污染物的毒害性廢水處理中的共性和關鍵性難點問題建立了可靠的技術途徑。

　　改革開放之初具有豐富實踐經驗，年逾七旬的簡浩然先生指導年輕科學家攻克油制氣廠污水處理，近年以該所副所長孫國萍研究員為首的研究團隊堅守環保第一線，先后在環境微生物資源及其分子生物學領域，油制氣廢水、垃圾滲濾液、印染廢水等高濃度、難降解廢水治理的研發，惡臭和有毒有害工業廢氣的治理，以及化學物質的環境生態安全評價方面取得了一系列的成果。廣東省微生物所長期立足于廣東省公益性環境保護與污染治理的難點問題，開展典型環境污染物的微生物資源與微生物降解機制的原創性基礎理論研究、高新生物工程技術應用開發與生態安全評價及預警技術研究，逐漸形成了實驗室基礎研究和實際應用緊密結合的鮮明特點。為企業解決了多項環保難點問題和關鍵性共性問題，為廣東省特別是珠三角地區的環境保護作出了積極的貢獻。

　　在中科院與廣東省新一輪科技合作中，廣東省微生物所積極參與中科院佛山產業技術創新育成中心的建設，已建成的生態毒理與環境安全實驗室成為中科院這個平臺第一個為社會服務，產生社會效益和經濟效益的實驗室。2011年2月11日，全國人大常委會副委員長、時任中國科學院院長路甬祥視察該實驗室時給予充分肯定：沒想到這么快就投入使用，很務實、做得好！

　　5月19日，中共中央政治局委員、廣東省委書記汪洋，廣東省委副書記、省長黃華華在聽取了該室負責人匯報后，關切地詢問道：“什么時候可以拿到相關的國際資質？”臨走時汪洋希望該室取得相關國際資質，打破國外的技術壁壘，為我國的化學品出口掃清道路。