在福州舉辦的中國(guó)菌物學(xué)會(huì)2024年學(xué)術(shù)年會(huì)上，福建農(nóng)林大學(xué)鄧優(yōu)錦副教授做了題為草菇主栽品種NF-7全基因組分子標(biāo)記的構(gòu)建的報(bào)告分享。
食用菌作為一類(lèi)具有食藥用功能的大型真菌，在推動(dòng)循環(huán)農(nóng)業(yè)和提高農(nóng)民收入方面發(fā)揮了重要作用，也是脫貧攻堅(jiān)的重要產(chǎn)業(yè)。然而，近年來(lái)隨著品種選育和引種栽培的快速推進(jìn)，食用菌品種名稱(chēng)的混亂問(wèn)題日益凸顯，“同物異名、異物同名”的現(xiàn)象普遍存在，給食用菌生產(chǎn)帶來(lái)了不必要的困擾，也對(duì)種質(zhì)創(chuàng)新造成了嚴(yán)重的阻礙。
草菇是發(fā)源于中國(guó)最著名的食用菌之一。因其在自然狀態(tài)下草菇生長(zhǎng)在稻草堆中，俗稱(chēng)“稈菇”(稻草菇)，也被稱(chēng)為“中國(guó)蘑菇”。作為高溫食用菌和草生食用菌的代表，草菇的栽培周期極短，僅需14天，而備受青睞。因此鄧優(yōu)錦副教授帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)對(duì)草菇主栽品種NF-7進(jìn)行了深入的全基因組分子標(biāo)記研究。他們首先進(jìn)行了草菇NF-7的異核基因組組裝，成功獲得了核A、核B的完整基因組序列以及線(xiàn)粒體基因組序列，并揭示了三者間的比例關(guān)系，從而全面掌握了草菇NF-7的遺傳信息。
在基因組組裝質(zhì)量驗(yàn)證方面，鄧優(yōu)錦副教授采用了多種方法進(jìn)行驗(yàn)證，包括正向驗(yàn)證、反向驗(yàn)證、異核分型驗(yàn)證以及染色體構(gòu)架驗(yàn)證等，確保了基因組組裝的準(zhǔn)確性和完整性。他們還利用Hi-C交聯(lián)信號(hào)揭示了每條染色體構(gòu)架的準(zhǔn)確性，進(jìn)一步提高了基因組組裝的可靠性。
基于全基因組信息，鄧優(yōu)錦副教授開(kāi)發(fā)了一套分子標(biāo)記鑒定流程。該流程通過(guò)將待測(cè)菌株的基因組序列分割成100-bp片段集，并與參考基因組進(jìn)行比對(duì)，從而計(jì)算出SNP數(shù)量，進(jìn)而實(shí)現(xiàn)菌株的快速準(zhǔn)確鑒定。該鑒定流程具有檢測(cè)準(zhǔn)確性高、操作簡(jiǎn)便等優(yōu)點(diǎn)，可廣泛應(yīng)用于食用菌產(chǎn)業(yè)的品種鑒定和種質(zhì)創(chuàng)新中。
此外，鄧優(yōu)錦副教授還利用該分子標(biāo)記鑒定流程對(duì)菇廠采集的菌株進(jìn)行了鑒定，成功區(qū)分了不同來(lái)源的菌株，為食用菌產(chǎn)業(yè)的種質(zhì)資源管理和品種選育提供了有力支持。
據(jù)悉，由中國(guó)菌物學(xué)會(huì)主辦的“2024年中國(guó)菌物學(xué)前沿論壇，并在同期召開(kāi)中國(guó)菌物學(xué)會(huì)第八屆理事會(huì)會(huì)議及《菌物學(xué)報(bào)》《菌物研究》編委會(huì)”將于12月27日至31日在海南海口舉行。屆時(shí)，鄧優(yōu)錦副教授將再次與大家相聚，并作題為“銀耳異核基因組非對(duì)稱(chēng)現(xiàn)象及其附屬染色體多樣性分析”的報(bào)告分享，歡迎廣大從業(yè)者參會(huì)交流！
會(huì)議報(bào)名及收費(fèi)收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)：（含會(huì)議服務(wù)費(fèi)與資料費(fèi)，其他費(fèi)用自理。）中國(guó)菌物學(xué)會(huì)會(huì)員代表1000元/人；非會(huì)員代表1200元/人；學(xué)生800元/人。
報(bào)名方式：請(qǐng)?jiān)陔娔X登錄下面網(wǎng)址或用微信掃描識(shí)別以下二維碼，并完成交費(fèi)，即可報(bào)名成功。如需現(xiàn)場(chǎng)刷公務(wù)卡，請(qǐng)?jiān)趥渥⒄f(shuō)明。
電腦注冊(cè)網(wǎng)址：https://hybg.cast.org.cn/home?id=34436
微信注冊(cè)通道
本次會(huì)議委托武漢菌博會(huì)展服務(wù)有限公司負(fù)責(zé)會(huì)務(wù)執(zhí)行并開(kāi)具會(huì)議費(fèi)發(fā)票。如需通過(guò)對(duì)公轉(zhuǎn)賬支付，可匯款至以下賬戶(hù)（備注代表姓名）：戶(hù) 名：武漢菌博會(huì)展服務(wù)有限公司開(kāi)戶(hù)行：中國(guó)工商銀行股份有限公司武漢軟件園支行賬 號(hào)：3202105809100083763
會(huì)議住宿
會(huì)議住宿酒店：澄邁景廷酒店。
費(fèi)用標(biāo)準(zhǔn)：大床房：380元/間/天（含早餐）標(biāo)準(zhǔn)間：380元/間/天（含早餐）
預(yù)訂方式：請(qǐng)代表在微信掃碼會(huì)議注冊(cè)時(shí)選擇房型進(jìn)行預(yù)訂，住宿費(fèi)用在入住時(shí)交費(fèi)給酒店，由酒店開(kāi)具住宿費(fèi)發(fā)票。
會(huì)務(wù)組聯(lián)系方式
會(huì)議負(fù)責(zé)人：
中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所：馬海霞 18289762269
中國(guó)菌物學(xué)會(huì)辦公室：蔣娜13488729204
易菇網(wǎng)：趙雄 13268645196
會(huì)務(wù)聯(lián)系人：
易菇網(wǎng)：王 瓊 15172475491 微信同號(hào)
易菇網(wǎng)：田利萍 15807149797 微信同號(hào)
編委會(huì)聯(lián)系人：
《菌物學(xué)報(bào)》王 敏 15718876885
《菌物研究》李艷雙 13104493816
報(bào)名系統(tǒng)技術(shù)支持：
中科科界：魏雨晴 13870620906
