2、不利因素
?。?） 管理不規范、產業化程度低
我國食用菌生產仍以傳統模式為主，大多依靠農戶手工操作的方式進行種植，行業管理不規范，產品質量參差不齊；食用菌生產的發展也較為盲目，生產種類集中在幾個較為有限的品種，沒有調控機構進行統一的管理和控制。
?。?） 缺乏權威市場信息發布體系
目前，我國還沒有權威的食用菌市場信息發布體系，信息監測和處理系統建設較為滯后，面對不斷變化的國際國內食用菌市場，面向全社會的公益型食用菌市場信息服務體系有待建設完善。
（3） 科研人才不足
我國工廠化生產食用菌的產量逐年上升，企業數量也不斷增加，對于專業科研人員的需求與日俱增，尤其是同時具備先進科研理論知識與豐富實踐經驗的人才，科研人才不足成為妨礙行業發展的制約因素。
（4） 市場競爭無序
近幾年，數量不斷增長的食用菌工廠化產品集中上市，對市場流通體系帶來了沖擊和考驗，此外由于信息不暢等原因造成市場競爭較為無序，出現了個別品種、個別區域的供需失衡，2013 年食用菌工廠化生產企業數量自2008 年以來第一次出現了負增長。
