目前我國食用菌總產量占全球75%以上。從2008年到2016年工廠化的企業數量逐漸上升，到現在為止已經達到接近600家。工廠化產能目前穩居全球首位，占全球食用菌工廠化總產量的43%，2010年到2016年日產量可以達到7000多噸，這是其他國家不能比擬的。
2015年我國食用菌工廠化品種最多的是金針菇，其次是杏鮑菇，其他包括香菇、蟹味菇等。超市里能看到的種類不斷豐富。全國食用菌類的出口額穩步上升，2016年同比增長8%，超過30多億美元。全國食用菌上市企業也在突飛猛進地增加，近幾年來，15家食用菌企業和8家藥用菌企業分別在主板、新三板和中小企業板上市，很多資金進入這一產業。
現在中國大面積種植的香菇，基本上都是一個媽的孩子，都是從日本引進的最早的香菇品種繁衍下來的，這是非常嚴重的問題。菌種混亂、品種混雜、質量標準不統一，幾乎全部為國外品種壟斷，木腐菌品種來自日韓，草腐菌品種來自歐美，我們自有知識產權的品種還沒有。食用菌的菌種是這個產業可持續的起點，應該緊緊抓在我們自己手里。
精深加工能力不足也是制約我國食用菌產業的一個問題。我國食用菌加工品種500多種，加工率只有6%，而國外的加工率達到75%。
菌物研究還有很多延伸領域，比如藥業。建議把“菌物藥”納入中藥范疇。目前看來，利用菌物藥生產的一些新型的可以治療疑難雜癥的藥劑，有非常廣闊的前途。比如日本生產的一種腫瘤切除術后使用的注射藥物——天地欣，成分就是香菇多糖，一針賣到1680元。但中國沒有一家企業能生產出這種高純度的同類藥物，類似的例子非常多。
