一是市場窄。我國食用菌主要出口至日本、歐盟和美國，然而近年來遇到的農產品環保壁壘層出不窮，出口市場的集中也導致了較高的市場風險。以全國最大的食用菌主產區－－寧德為例，日本是該市食用菌出口第一大市場，2006年共出口日本7422.44噸、2251.07萬美元，分別占寧德市出口食用菌的47.69%和56.45%。日本從2006年 5月29日起正式施行《食品中殘留農業化學品肯定列表制度》，受其影響，2006年下半年寧德市輸日保鮮食用菌出口量大幅下降了37.8%。

二是壁壘強。歐盟于2006年 l月開始實施食品及飼料安全管理新法規，特別是日本肯定列表的實施，大大提高了食用菌出口的技術門檻。根據福建檢驗檢疫部門對轄區種植戶種植過程用藥情況和農藥市場進行的摸底調查結果顯示，食用菌藥殘狀況不容樂觀，加強源頭管理勢在必行。

三是技術低。多是農戶零散生產，生產者的素質和栽培條件不一，栽培規范和標準難以實施，特別是無公害綠色食品和病蟲害防治科學用藥要求難以把握控制，產品質量差異大。生產規模或高或低，容易菇賤傷農。

四是加工弱。國內相當部分加工企業還停留在保鮮、烘干、鹽漬等粗加工的層次，深加工能力普遍較弱。目前的栽培模式無法做到均衡生產，必然出現菇量大起大落，每年有大量鮮菇需要通過加工罐頭等來調節，加工瓶頸問題突出。

五是競爭烈。近年來，不少省份充分重視和扶持食用菌產業，使食用菌產量和質量有了較大提升，但另一方面，各地企業之間的競爭也更加激烈。為爭取國外客戶，國內出口企業往往采取競相壓低價格的辦法，一些出口企業甚至采取賠本也要做生意的方式，結果導致出口食用菌利潤微薄。

六是管理難。目前食用菌原料異地供貨現象比較普遍，由于不同產地的食用菌原料衛生質量存在差異，且絕大部分企業目前基本上沒有檢測手段和能力，難以在進料時把好關，相應也增加了政府部門的管理難度。

七是標準缺。目前僅在農藥殘留限量的指標上，國際食品法典有2572項標準，而我國相對較少，與國際標準相比尚存在差距。
為此建議：

一是大力推行綠色、無公害生產，在種植過程中推廣實施GAP體系，逐步實現生產過程的標準化、規范化，提高食用菌產品質量。

二是建立健全衛生質量保障體系，進一步加強對農藥生產許可、生產、市場流通等環節的管理，食用菌主管部門應加強對種植規范、技術的宣傳和指導，特別是重點引導種植戶杜絕禁用藥的使用和科學合理用藥。

三是從資金借貸上加大扶持力度，積極鼓勵企業產業升級，統一產品質量標準，嚴格企業市場準入評定關，加大力度培植規模化經營的龍頭企業或集團公司，逐步改變生產企業無序競爭、相互內耗的狀況。四是進一步優化品種結構，充分發揮香菇、黑木耳等傳統品種的優勢，同時組織力量加大食用菌新品種的研究與開發，提高珍稀品種的出口比例。

五是加強宣傳，擴大我國食用菌的知名度，全面實施品牌戰略，克服小、多、散現狀，進一步提高在國內外市場的份額和知名度。