2011年7月，四川省政府出臺《“十二五”農業科技創新與轉化推廣發展規劃》，針對當前保障糧食糧食安全、統籌城鄉發展、轉變農業發展方式、農民持續增收等農業各環節中的科技需求提出，到2015年農業科技進步貢獻率達到56%。對此四川省科技廳認為，農業科技創新涉及部門多、層次多，科技資源分散，農技推廣越位、缺位、錯位與生產需求脫節，要進一步提升農業科技水平，必須創新農業科技體制機制。
　　而四川農業科技創新產業鏈示范工程，正是以體制機制為突破口，立足服務完整產業“鏈”發展，創新了技術攻關與產業發展、創新團隊與產業發展、平臺建設與產業發展和機制體制創新與產業發展的結合方式，切實體現創新與轉化、技術與產業、管理與績效的“三個一體化”，實現生產與市場、技術與經濟有機結合。在設計思路上，工程各示范項目都以整條產業鏈為對象，強調技術集成；在團隊組織上，各項目均建立了產業技術創新聯盟和多學科、跨領域、跨部門的技術專家團隊，參與人員包括了相關領域最優秀的專家，涉及單位之多、學科范圍之廣、領域跨度之大、專家團隊力量之強前所未有；在管理機制上，首次嘗試牽頭企業和首席專家雙重管理機制，首席專家負責項目運行，但主持單位必須是企業，雙方共同管理，最大限度提高技術供應效率，破解了生產與科技“兩張皮”現象。同時，在項目運行中，采取“創新團隊龍頭企業示范基地帶動農戶”四位一體的合作模式，創新成果直接在參與企業應用，并通過建立新品種、新技術、新模式示范基地，進一步向全省輻射推廣；龍頭企業向上游延伸，建立原料基地，帶動周邊農戶發展；建立企業、專家與農戶的利益機制，實現產學研農互動的長效發展模式。在食藥用菌產業鏈，針對品種選育、高效生物技術、產品價格和廢棄物利用等，已集成創新14類28項新技術。其中，產業鏈前端，示范推廣工廠化栽培金針菇、杏鮑菇等新品種2000多萬袋（棒），新增利潤1200余萬元；中端，改造食用菌工廠化生產技術，提出食用菌生物轉化、規劃化生產技術，幫助農民人均增收1500元；末端，開發無硫化食用菌即食食品、下飯菜，創新研發菌茶、咀嚼片、保健品等新產品10余個，每年為企業增收4000萬元。
　　而工程實施以來，四川先后示范推廣涵蓋產前、產中、產后的科技成果800余項，組建科技特派員工作站、專家大院60個，選派科技特派員1400多名，建立科技示范基地三十余個，核心示范區面積15萬畝以上。“通過工程實施中的農業科技發展模式創新，推動了四川農業現代化內生動力的形成。”韓忠成說，在項目實施中，一些產業鏈還探索了農業產業鏈與技術鏈協同推進、企業與專家團隊雙贏合作、學科交叉融合集成創新的新模式；形成了政府、機構、企業三方參與的多元化科技投入機制；構建了科研單位主動融入市場需求、行業企業主動對接產業鏈研發機構的科研交叉融合、產學研協同攻關的新體系。