一是恢復了菌種原有的生物特性
究其原因，除了供種單位管理混亂、職業道德差等因素外，主要原因就是菌種在長期的保存、轉管、再保存、再轉管的頻繁轉擴過程中，不可避免地沾染了病毒、病菌，從而使菌種發生了退化或者變異。
二是抗性得到了增強
在脫毒過程中，采取一系列的高低溫鍛煉、營養貧乏等技術手段，迫使菌株適應惡劣的條件，在“優勝劣汰，適者生存”的競爭機制下能夠適應且表現良好的都是能夠提高抗性的好菌株。
三是抗病性提高了
經過近10多年推廣，結果表明，脫毒菌種較之普通菌種發病率下降60%以上。近年生產中發生嚴重的黃斑病、褐腐病等給廣大菇農朋友造成了巨大的經濟損失，使用脫毒菌種后發病率明顯下降，大大提高了菇農的生產效益。
