袋內補水，是提高平菇產量和質量的技術措施。哪些袋宜補水呢?一是看菌絲的長勢。即料內菌絲生長旺盛、濃密、潔白的菌袋。二是看培養料含水量，即含水量已顯著下降(低于50％)的菌袋。三是自然溫度穩定在8℃以上。凡符合上述條件的，均可在出菇期內向料內補水1～3次。第1次補水時間為頭潮菇采摘完畢，第2次為3潮菇結束時。如果料內菌絲長勢細弱、菌絲發黃、生活力下降，或料內水分適中，或自然溫度降至5℃以下，或料內已發生病蟲害等，均不宜補水。

袋內補水的方法：袋栽平菇頭潮菇采收結束后，用1支或多支專用補水器，利用普通噴霧器上的接頭、開關等零部件與1根塑料管或橡膠管連接，另一端則接在自來水龍頭上(沒有自來水的可用微型水泵抽水代替)。先打開自來水龍頭開關，將補水器插入料內，再打開水管上的備用開關，水在有壓力的狀況下就會順利補進料內。一袋補足后，關閉手頭開關，再補另一袋。水分的補充標準是使菌筒的質量達到裝袋時的質量或者略高一點。一般裝1000克干料的菌筒，補水后的質量應達到2500克。經補水后，可連續出2~3潮優質平菇，總產量可比常規出菇法提高50％。如果前期未能補水，采收3~4潮菇后只要料內菌絲生長旺盛，自然氣溫10℃以上，仍然可以補一次水，但補水量應降低20％～30％，后期仍可出1～2潮好菇。該補水法在高溫季節切不可用，以免導致整體污染。