【作者】劉俊 馬超君 向星潔 李闖 邊銀丙 張健 肖揚
【機構】華中農業大學應用真菌研究所 湖北長久菌業有限公司
摘要:以95份野生香菇(Lentinula edodes)種質和1份栽培種質為材料,在利用相關序列擴增多態性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)標記開展遺傳多樣性分析的基礎上,采用屬性約簡啟發式算法和逐步聚類位點優先取樣法分別構建核心種質。兩種方法分別得到35份(Core 1)和29份(Core 2)種質,其核心種質保留比分別為36.5%和30.2%,位點保留比分別為100%和94.7%。基于有效等位基因數,Nei’s基因多樣性指數,香農信息指數等四個參數對兩組核心種質進行t測驗,結果顯示兩組核心樣本均能很好的代表原始種質的遺傳多樣性,但Core1具有更高的位點保留比例且地理來源更加廣泛,確定為代表96個原始菌株的核心種質庫。
基金:國家科技支撐計劃子課題(2013BAD16B02)資助;
關鍵詞:香菇; 相關序列擴增多態性; 遺傳多樣性; 核心種質庫;