秋季氣候比較干燥，降溫保濕及防治病菌是有機平菇出菇期種植的措施之一。
9月、10月正值種菇季節，為提高秋冬平菇種植成功率，減少病害發生，種植戶應注意以下管理要點。
1.有機平菇嚴格培養料發酵。從嚴把關平菇培養料質量、培養料配方和玉米芯發酵程序，發酵好的培養料應達到：培養料表層布滿白色高溫放線菌，顏色變為紅褐色或咖啡色，質地柔軟，無氨味和酸臭味，含水量適中。
2.有機平菇嚴控發酵料溫度。一是保證培養料發酵期間溫度在65℃～75℃;二是保證培養料發酵期間，培養料溫度均勻;三是保證裝袋時培養料散熱徹底，降至30℃以下。
3.嚴格控制發酵料濕度。重點做好培養料預濕、翻堆調水工作，保證培養料發酵好后培養料水分控制在65%左右。
4.嚴格防霉、防蟲。培養料要添加質量合格的殺菌劑。目前，平菇種植應用最多的是克霉靈，使用量一般為0.1%或每7立方米1公斤。另外，翻堆時可在培養料中噴灑殺蟲劑如敵敵畏、敵菇蟲、蟲螨凈等進行堆悶殺蟲。
5.嚴格做好場地消毒。菇棚進袋前，通過石灰消毒法、化學消毒法以及高溫消毒法對栽培場地進行消毒處理，發菌出菇期定期噴灑殺菌劑，避免病害發生。
6.密切注意菌袋溫度。如果菌袋溫度超過25℃，一定要及時采取必要措施降低菌袋溫度，如加大通風、降低擺放層數等。
7.創造有利于平菇生長的條件。做好發菌場地通風、溫度、濕度管理，減少各種病害的發生。另外，對于平菇病害要有“預防為主、治療為輔”以及“早發現、早治療”的病害防控思路，減少平菇病害的發生。
