天麻屬異養性植物，種子必須依靠小菇屬一類真菌侵染才能正常發芽，其后的生長又需要蜜環菌菌索的侵入提供營養才能繼續生長而完成其生活史。優良的“天麻兩菌”由此成為天麻產業發展最為重要的保障。漢中地區是我國人工栽培天麻技術的發源地，近年來漢中一批科研單位，不斷提高科研投入，先后選育、篩選，一批具有優良性狀的菌株被廣泛應用到生產中，為全國天麻栽培起到保駕護航的作用。

據了解，由寧強縣真菌研究所選育、篩選的：萌發菌-MD-1、紫萁小菇-ZQ、萌發菌-Md、石斛小菇-QM1#，陜西理工大學陜西省食藥用菌工程技術研究中心選育、篩選的萌發菌-MD、萌發菌-3，西鄉縣食用菌研究所選育、篩選的石斛小菇-SH、8103、萌發菌-8，漢中植物研究所選育、篩選的萌發菌-W等菌株，經過幾年大規模的生產和栽培使用，在伴栽天麻蒴果促進天麻種子萌發方面具有良好表現，各個菌種生產廠家的母種、原種銷售全國各地，漢中地區年產近千萬袋萌發菌銷往全國，并一度占據較大市場份額，為我國天麻產業健康發展起到積極作用。

近年來，隨著天麻“藥食同源”試點工作的逐步開展，天麻市場行情逐漸上漲，對天麻兩菌的需求也逐漸增加，漢中優質的萌發菌菌種也將發揮越來越加重要的作用，產生更大的社會效益。