吉林省農委成立由業務主管領導、大專院校科研人員、食用菌專家等人員組成的評選活動組委會，下設籌備組、檢測組和專家評審組，人員互不交叉。由農業部參茸產品質量監督檢驗測試中心和吉林農業大學教育部食藥用菌工程研究中心對黑木耳農藥殘留、重金屬、營養成分及商品性狀等方面進行檢測，對檢測樣品綜合打分排序。重金屬、農藥殘留兩項為主要評分指標，重金屬主要檢測砷、鉛、鎘、貢，農藥殘留主要檢測多菌靈、吡蟲啉、敵敵畏、毒死蜱、氧樂果、滴滴涕、六六六。經檢測,所有的參選樣品農藥殘留檢測值都是零，這是黑木耳種植的重大成就。重金屬方面，以高于國家食品質量安全標準的限值為評判閾值，取消超過此閾值的參選產品的排序資格。
作為吉林省黑木耳的獲獎單位，組委會在重金屬檢測方面確定了更高的標準，以高于國家標準1倍以上作為入選條件。綜合上述各方面的檢測及鑒定結果，對各參選產品進行評分排序，16家黑木耳生產經營單位參選樣品獲得通過。
