1、褐腐病
（1）癥狀
褐腐病只危害子實體，不感染菌絲。發病初期菌褶和菌柄下部出現白色綿毛狀菌絲，病情發展，病菇呈水泡狀，嚴重時不能形成子實體。病菇后期流出褐色液體，散發出惡臭氣味。
（2）發生及流行條件
病菌主要通過覆土帶入菇房，靠孢子傳播。病菌適于郁閉、潮濕的環境，菌絲生長的最適溫度為25攝氏度。適宜的PH值為6.2，在10攝氏度以下極少發病，15攝氏度以上發病嚴重，在50-60攝氏度的高溫條件下，經1小時即會死亡，在菇房通風不良、空氣不流通、濕度過大、培養料濕度過大的情況下易發生該病。
（3）防治方法
①消滅覆土中的病菌。該病的主要傳染源是覆土，因此，進行覆土消毒可有效地防治該病。常用的土壤消毒方法有：用60-65攝氏度的熱蒸汽處理1小時；用70%多菌靈可濕性粉劑或70%托布津可濕性粉劑500倍液對覆土噴霧；將覆土置于空室內，按每立方米覆土加50毫升甲醛、25克高錳酸鉀的比例熏蒸24小時，熏蒸時，保持室溫15攝氏度。
②發病初期，應及時停止菇房噴水，加強通風，盡量降低菇房內的濕度，降低二氧化碳濃度，同時降低室內溫度15攝氏度以下，避免發病環境條件。
③發病嚴重時，應更換覆土，燒毀病菇，對病區和所有的工具用4%甲醛液消毒。
2、褐斑病
褐斑病又稱干泡病、輪枝霉病。主要危害平菇、金針菇等。
（1）癥狀
主要侵害子實體，病菇蓋上產生許多針頭狀褐色斑點，斑點擴大后，產生灰白色凹陷。幼嫩的子實體發病，常在一側發病，使菇體呈洋蔥狀畸形，菇柄出現剝皮現象。后期發病，菇柄變粗，變褐色，表層剝裂，菌蓋逐漸縮小，常有疣狀附屬物、菌蓋干裂，歪斜畸形。營養菌絲不會染病，但子實體分化前，病菌可延菌絲索生長，形成質地較干的灰白色組織塊。一般病菇不腐爛，不分泌褐色汁液，也無臭味。
（2）發生及流行條件
病菌適于低溫高濕的環境條件。病菌的孢子主要通過濺水傳播，也能通過菇蠅、螨類、操作工具、氣流、覆土、培養料以及栽培者帶入菇房進行傳播。覆土和培養料過濕均有利于本病的發生。
（3）防治方法
①培養料要進行高溫發酵或堆制，以消滅病菌。覆土要消毒，方法同褐腐病。
②生產工具等均用4%甲醛液消毒。
③嚴格防止菇蠅和菌蛆的發生。
④避免覆土過濕，注意通風降低濕度。
⑤發病后要及時清除病菇，并在發病區用50%多菌靈可濕性粉劑或70%托布津可濕性粉劑的500-800倍液噴霧。
