(一)出耳培養基的配制
       出耳培養基的配制方法同原種和栽培種，但配方多樣化。可根據當地資源條件選用相應配方，配方詳見表二。表中配方以配方二最高產，其次配方一、配方三。
      表二 黑木耳培養基的配
      一 二 三 四 五 六 七
木屑 78 48 　 　 　 　 8
棉籽殼 　 30 78 　 　 　 75
玉米蕊(黃豆大顆粒) 　 　 　 　 　 77.5 　
稻草(粉碎) 　 　 　 　 　 　 75
谷殼 　 　 10 　 　 　 　
蔗渣 　 　 　 87.5 　 　 　
粉碎豆秸桿 　 　 　 　 88 　 　
麩皮 20 15 10 10 10 20 15
糖 1 1 1 1 1 1 1
石膏 1 　 1 1 1 1 1
碳酸鈣(石灰) 　 2 　 尿素0.5 　 0.5 　
含水量(%) 56 58 60 58 56 58 58
      (二)拌料、裝袋和滅菌
      按生產菌袋的數量計算總用量，選擇新鮮無霉變質的培養料，然后按配比稱取各種原料，把糖和磷肥溶解在水中，進行拌料。料與水比例為1:1.3左右。含水量以手緊握培養料指縫間有水欲滴為宜。培養料中含水量在60%，堆悶30分鐘后。裝袋稍加壓實并捆扎袋口。出耳菌袋規格為17×35×0.04。料袋的滅菌方法與制原種和栽培種相同，但由于菌袋生產采用大鍋爐滅菌，滅菌袋數量大，不易滅透，故應想應延長滅菌3~4小時。即在100℃條件下應維持滅菌12小時以上。
      (三)接種方法
      黑木耳出耳袋的接種方法，以前采用袋內預留孔穴法，先前留一個通袋長孔，滅菌后將菌種塞入。但此法，不適合大規模生產滅菌采用。目前，廣泛采用貼膠布法、石蠟封口法和套袋法。
      1．貼膠布法
      將裝好的料袋(長40厘米左右)，用打孔器打4個孔，孔寬1.5厘米，深1.5厘米，孔距10厘米，用3×3厘米氧化鋅膠布貼好，滅菌。接種時掀開膠布，接入菌種，然后重新用原膠布封閉接種孔。每袋栽培種可接30袋出耳袋。
      2．石蠟封口法
      在無菌操作前提下，用木錐打孔器在料袋正面打3孔，孔徑1.5厘米，深1.5厘米。用接種器或手點上菌種，然后用加熱液化后的石蠟，用毛刷粘取涂抹接過種的穴口。再翻袋，在背面再打2孔，并按上述方法點種，涂抹液化石蠟，石臘會當即凝固并封口穴口，每袋栽培種可接30袋出耳袋，此法接種速度快。同時，加熱液化石臘可以殺死接種穴周圍雜菌，防止雜菌污染，提高制袋成功率。
      3．套袋法
      采用石蠟接種法中用木錐打孔，點種方法接上菌，然后迅速套一層薄袋 (薄袋寬規格比料袋大2厘米)，并扎上套袋口。此法操作簡便，而且發菌定植快，雜菌污染率低，是目前廣為采用的一種接種方法。
      (四)發菌培養
      黑木耳菌袋培養室，應清潔、干燥，具有良好通風環境條件。可用于作培養室的設施環境有：房屋、場房和遮陽塑料大棚，老場地應對發菌室反復清洗或消毒處理，發菌效果以前者為佳。菌袋在發菌場地的放置按“品”形或“井”字形堆放。培養室溫控制在22~26℃，第5~6天后開始翻動菌袋，不要強光和直射光，注意通風，空氣相對濕度以70~80%為宜。
      發菌期間應注意觀察溫度變化(袋溫不能超過32℃)，防止溫度升高燒菌。同時，應及時檢出雜菌袋，防止污染。此外，還應防止培養室光線過亮，最好在弱光或暗光下培養。
      當菌絲萌發至菌圈直徑達到8~10厘米大小時應及時給菌袋換氣，蠟封法只要翻倒菌袋即可；貼膠布法應掀一次膠布；套袋法可解開一次套袋口。菌圈互相接近時可撕掉膠布；解開套袋口。一般經過40~50天發菌期可發滿袋，菌袋發滿袋后可移入出耳場地進行出耳管理。