近年來，隨著香菇產業的不斷發展和政府政策性的“幫扶”推進，已逐步形成具有地方特色的香菇主產區，如慶元、泌陽、平泉、隨州、遵化、岫巖等等，香菇產業遍地開花，香菇市場的供求略有失衡，小農戶在產業中凸顯的問題隨之愈加嚴重——硬件設施落后，生產技術守舊，市場應變能力遲鈍等，如果生產香菇的品質沒有改觀，那么菇農勢必在香菇產業中淘汰出局。菇農轉變思維勢在必行，更多的菇農已能從觀念和行動上開始優質菇的生產，但循規蹈矩機械性地“拿來主義”，給香菇生產帶來了很多問題，這些問題足以導致栽培上的重大損失甚至毀滅性災難，現就幾種現象及問題進行總結分析如下：
1、滅菌：15.5cm*58cm的菌棒(裝袋重量4.5斤)，以往未加免割袋在滅菌倉內溫度達到100℃保持24小時，可視為滅菌成功，而加上免割袋后，因蒸汽溫度的穿透能力受阻，其空間溫度在達到100℃時，時間必須延長4小時以上，方可視為滅菌成功，若菇農在采用免割袋模式時，滅菌時間采用以往100℃24小時的滅菌方式，必然會導致菌棒滅菌不徹底，造成接種后的部分感染甚至全部感染，給生產帶來了重大損失。
2、養菌：在免割袋香菇養菌過程中，當菌絲長滿整個菌棒進行刺孔放大氧時，菌棒碼垛12層，四周須留15cm以上的通氣空間，每兩排預留40cm左右的通氣道以便于降溫通養，以往未加免割袋的菌棒菌棒碼垛13層以上，四周通氣空間10cm左右，且每四排預留30cm左右的通氣道，不會發生高溫燒菌現象，而加上免割袋的菌棒，其透氣性差，散熱能力降低，高速生長的菌絲如果沒有足夠的空間供給氧氣，往往造成菌棒內部菌絲酵解，或菌棒的惡性增溫，導致菌絲損傷，營養結構破壞，嚴重者，菌絲蛋白高溫變性，菌棒徹底崩潰壞死。
3、注水：在出菇管理過程中，菌棒存在“歇伏”管理，而伏天的7月和8月因天熱缺菇，香菇價位居高不下，很多菇農鋌而走險注水催菇，最后造成菌棒的大量壞死。由伏天“歇伏”轉變為伏天“出菇”自有其充分的條件，在常規的技術中，氣溫在28℃以下時，頭茬菇及以后注水量由90—95%依次降至80%，70%，60%等逐級遞減，而伏天溫度都在28℃以上，此時在低溫時間點注水外，其注水量較常規注水量下調15%左右，因為溫度超過28℃時候菌絲會出現“熱老化”現象，而這時的菌絲持水能力極差，一旦注水量超過其持水能力，則菌絲包外的游離水會阻斷菌絲的呼吸，同時也會因為溫度的升高而破壞菌絲的蛋白，導致菌絲壞死，菌棒潰敗報廢。
4、模式：單袋的水菇模式產出的香菇多數面向中低端市場消費，而且供應量大，不占有市場優勢，而免割袋的優質白頂香菇逐漸占領了市場取締淘汰了黑頂水菇，但白頂菇對棚內要求比較高，光照度應在600lx左右(四針遮陽網為宜)，此時香菇菇面偏白，菇柄細短，而黑頂水菇菇棚光照度普遍偏低，光照度在500lx以下(采用草簾遮陰或兩層遮陽網遮陰)，棚內光線相對較暗，造成菇蓋偏黑、菇柄粗長現象，品質不高價格低，而此時菇農普遍采用通風降濕來提高香菇品質，非但品質沒有改觀，產量也因為反復降濕而大大下降，最終造成香菇產量低價位低的困局，打消了菇農生產香菇的積極性，殊不知關鍵性問題在于光照，增加菇棚透光度便可有效解決香菇面黑腿長的問題，將菇棚草簾間隔性撤掉或棚體上方80cm左右撐起一層四針遮陽網即可。
多數人認為香菇種植是個粗放性的管理方式，勿須“精細”，但細細考究，那些盈利農戶幾乎都做到了“精細化”管理，并嚴格按照香菇生活習性理性地把握好每個技術關鍵點，雖然未曾深入到更深的理論層次，但在具體的溫度、濕度、光照和通風等技術關鍵點上皆與香菇的生物學特性相匹配。
