在雙孢菇生產中，出菇前后要求環境條件比較嚴格，管理比較精細，特別是空氣濕度調節對各個細節管理都有很大影響，如果管理措施不當，會影響雙孢菇正常生長發育，進而影響產量和品質。下面就雙孢菇出菇前后易出現的問題簡介如下：
　　一、濕度大，通風不良時，可發生病蟲害或造成冒菌絲。針對這個問題，出菇前必須加強通風管理，使空氣相對濕度保持在85%--90%之間。
　　二、覆土后，用水過多，菌絲弱或萎縮，原基形成減少。子實體出現"紅根菇"、"銹斑菇"；噴水過多、過急時，水滴容易流入料內，造成通風不良，使菌絲萎縮死亡，料變黑；用水不足，子實體瘦小易開傘，或出現"平頂菇"、"凹頂菇"，都會影響產量和質量。針對以上情況，在出菇前覆土后必須加強用水管理。覆土后15天左右，要及時噴一次重水，稱為"結菇水"，噴"結菇水"期間和噴水以后，菇房必須進行大通風，促進細土層的線狀菌絲變粗而形成菇蕾。而后停水2-3天，再恢復正常的保持水，即蒸發多少噴多少。
　　三、菌絲徒長（俗稱冒菌絲）。當絨毛狀菌絲向細土生長時，遇上室溫高，空氣濕度大，通氣不良時，菌絲會直立向上生長，且生長速度很快，使細土表層長滿菌絲，這叫冒菌絲。出現冒菌絲時先要加強通風換氣，降低室溫，并在細土層上覆蓋一層干細土，以抑制菌絲徒長。菌絲徒長后也可采用搔菌的辦法，即用幾根帶鉤的粗鐵絲，在有冒菌絲的細土表層輕輕來回耙菌，破壞菌絲結構，并配合降溫降濕通風的方法，幾天后便會長出菇來。 
　　四、結菌塊現象。培養料腐熟過度，濕度過大，室溫過高時，在料表層出現一簇一簇的短而濃密的絮狀菌絲，然后連接成塊，這種菌塊不會出菇。用結菌塊的菌種播種后，易出現結塊現象。菌絲結塊后，將菌塊挖掉，加強噴水及通風管理，仍可在土層內形成子實體。