氣溫回升后有機平菇的螨蟲開始對有機平菇造成危害，有機平菇發菌期受到害螨為害時，白色的菌塊變黑，并散發出難聞的霉臭味。幼菇或成熟的子實體受害時菌蓋或菌柄上出現褐色、黃色斑點，形狀不一；初期斑點中凹陷或孔洞，其邊緣深褐色，中間稍淺或空洞，但子實體不腐爛。
1、培養室、菇房及培養料消毒
菇房要安裝網眼細的紗門、紗窗，通氣孔亦要裝上紗網，房體四周的縫隙應用泥封嚴實，避免昆蟲飛入房內將螨帶到菌床。菌種培養室要建在遠離畜房、禽舍、倉庫的地方，室內嚴禁堆放木屑、棉殼等培養料及雜物；對培養室及菇房要經常消毒，用藥劑噴灑房屋四周、地面及栽培床架，以消滅螨及害蟲。培養料要經過兩次發酵或高溫消毒殺死料中的害螨。搞好環境衛生，減少雜菌污染，以減少螨類的侵染危害。
2、保證菌種絕對無螨
仔細檢查菌種，發現菌種瓶中有螨，要淘汰；或懷疑有螨的菌種要分房播種。
3、藥物滅螨
（1）藥物噴灑：用克螨特2000倍液、波美0.5－1.0度的石硫合劑。
（2）誘殺：將新鮮煙葉平鋪在菌螨危害的培養料面上，待煙葉上菌螨聚集較多時，輕輕將煙葉取下，用火燒掉；若發現仍有螨蟲，可按前法繼續，直至無螨蟲為止。
（3）其他方法：取沸水10毫升、醋100毫升、白糖10克，混勻，攪拌至溶解，待冷卻后，滴入一滴敵敵畏拌勻即為糖醋液。把紗布放入配制好的糖醋液中浸泡濕透，然后鋪放在螨蟲危害的培養料上或菇床上，誘集螨蟲到紗布上后，取下紗布用沸水將螨蟲燙死，多次重復，直到把螨蟲基本殺死。
