有機香菇在出菇期可按照以下方法進行管理。

　　1、催蕾管理

　　一般催蕾前的菌袋不需浸泡處理，但如果存在基料水分不足的情況，則應進行浸泡后再催蕾，以使第一潮菇盡量多而肥大；催蕾的方法有很多，一般常用的方法為：

　　（1）自然催蕾法：浸泡后的菌袋排入菇棚，加強通風和光照，不要任何輔助措施，數日后即可自然現蕾。

　　（2）驚蕈催蕾法：對菌袋采用木棒敲擊、地下滾動等辦法，使之受到“驚嚇”，現蕾速度較快。

　　（3）強光催蕾法：對棚內地面澆水，使之保持較高濕度，然后，揭開草苫等遮陰覆蓋物，使棚內進入直射光，對菌袋進行強光刺激，很快即有菇蕾現出；但要密切觀察，一旦棚溫達到30℃時，即應立即遮陰，并向棚頂噴水降溫。

　　（4）溫差催蕾法：準備鼓風機和噴水器械，揭開草苫等遮陰覆蓋物，利用陽光對菌袋一方面進行強光刺激，另一方面，棚內溫度急劇升高，待升至30℃時，進行保溫處理，使30℃保持到太陽落山后，揭掉覆蓋物，打開進出口，先用地下水對菌袋進行快速降溫，繼之開動鼓風機向棚內吹風，然后，利用晚間的自然降溫，棚內溫差可達15℃以上，催蕾效果不錯。

　　2、育蕾管理

　　該階段的主要管理任務是割膜和疏蕾。首先，菇蕾現出后，僅僅是一個個的灰褐色的小“肉疙瘩”，還沒有分化，但也沒有觸及塑膜，此時，即應及時進行割膜處理，方法是：使用鋒利的刀尖（現多使用壁紙刀），環繞菇蕾將塑料膜切割成“活動門扇”的樣子，既不妨礙菇蕾從中鉆出，又可防止過大的風流進入，以避免基料的水分過多散發。注意：不可待菇蕾觸及或頂到塑膜后再割膜，否則，將會產生畸形菇。其次，或者在割膜時、或者在幼蕾鉆出后，發現有叢生的如有兩個、三個或更多的菇蕾擠在一起時，即應進行疏蕾處理，方法很簡單：用刀尖將邊緣的菇蕾切去就行了，如果操作不方便，也可以只將其上半部分（大約是菌蓋部位）削去，保留一個長相端正、形態圓整的即可。

　　3、蹲蕾管理

　　作物栽培中，有一個“蹲苗”的做法，在香菇生產中，也有類似的措施，就是蹲蕾，目的就是培育個大、肉厚的厚菇或花菇，做法很簡單，就是降溫。如幼蕾喜歡在15℃～22℃環境下生長，在14℃下的長速明顯下降，如有條件，降溫于12℃左右，甚至8℃左右，則可達到蹲蕾的目的；如果配合短時的直射光和偏低的空氣濕度，將會有助于蹲蕾的效果。一般在15℃左右約持續一周左右，即可達到蹲蕾的目的。

　　4、環境調控

　　（1）溫度：應根據菌株的生物特性而定。一般香菇菌株的子實體發育階段以15℃～22℃為適宜條件，低于5℃時，子實體無法分化和發育，高于28℃時，子實體發育速度明顯加快，但菌肉薄、易開傘、色澤淺、品質差。

　　（2）濕度：出菇階段以保濕為主，應調控空氣濕度在90%以上，如果培育花菇，則可根據其不同發育時期調控至60%～70%。

　　（3）通風換氣：除保溫等特殊要求外，一般要求棚內要有較新鮮的空氣條件，應控制二氧化碳濃度在0.5%以下。

　　（4）適當光照：除特殊栽培環境如人防工事、天然山洞等場所需要增加光照外，菇棚要根據子實體的生長要求，通過揭蓋覆蓋物來調控棚內的光照，否則，光照不足時，將使菇體色澤不好，影響商品質量。