杏鮑菇的栽培品種應根據市場的需求來選擇栽培菌株。目前用于生產的杏鮑菇菌株從形態上可分為兩種類型：
      （1）棍棒狀菌株。子實體棍棒狀，菌柄上下粗細均勻，中間和基部無膨大現象，菌柄不粗壯。有一種是原來使用較久的菌株，產品適合出口要求，價格高，保存時間長，但出菇慢，產量較低，且易受細菌感染。近幾年推廣的棍棒狀新菌株是經雜交育種或太空育種選育出來的優良菌株。產品質量好，抗病能力強，產量高。
      （2）保齡球形菌株。子實體的菌柄中間膨大，上下較細，形似保齡球。朵形較大，組織疏松，口感較差，產品保存期較短，以內銷為主。在適溫下栽培產量高。如遇18℃以上高溫以及通風不良的環境極易受細菌感染。這種菌不適合用于工廠化栽培。