食用菌生產中常用棉殼或木屑培養基制作固體原種和栽培種，少數使用麥粒或玉米粒等顆粒種，其實，采用稻谷作谷粒菌種培養基效果更佳。
　　稻谷顆粒種制作方法
　　稻谷用清水浸泡48-60小時至吸足水分，用清水或人工配制的營養水煮沸，至米熟而不開花。濾干攤涼，烘干表面水分，加入1%-3%石膏粉拌勻。裝入鹽水瓶或塑料袋，裝量不超過半瓶或1/3袋。鹽水瓶用棉塞封口，塑料袋折疊封口。在121-125℃高溫滅菌2小時，冷卻后接入菌種。待菌種萌發、生長至每團菌種沾附10粒左右稻谷時，搖瓶或倒袋，將團粒搖散。繼續培養，結成10粒左右團塊時再次搖散，每次搖瓶或倒袋前，挑出帶雜菌的菌種。如此反復4-5次，待全部稻谷都長滿菌絲即可使用。
　　稻谷顆粒種與麥子或玉米顆粒種的優勢比較
　　由于稻谷有穎殼，煮沸時容易掌握熟而不開花的度。塑料袋裝稻谷顆粒種，即使倒袋不及時，菌種結成塊，也可以擠壓搓碎，并且穎殼內菌絲所受傷害不會很大，而已成團的麥子或玉米顆粒種很難再弄成單顆粒。
　　稻谷顆粒種與棉殼或木屑原種、栽培種的優勢比較
　　1、棉殼或木屑原種長滿菌絲后結成塊狀，使用時不易將其搗碎，且接種速度慢。栽培種搗碎時，菌絲受傷嚴重，接種后菌絲萌發慢，吃料慢，污染率高。稻谷顆粒種培養時經常搖瓶，不易結塊，使用時直接傾倒出來，接種速度快，生長在穎殼內的菌絲不易受傷，接種后菌絲萌發快，吃料快，正品率高。
　　2、木屑或棉殼菌種常因檢查雜菌不及時而將雜菌遮掩，而稻谷顆粒種在菌種被搖散的同時，雜菌也被搖散，有利于檢雜，提高菌種的純度。
　　3、瓶裝棉殼或木屑菌種，上下菌種菌齡差別很大，如香菇菌種上下相差40-60天。接種后菌絲萌發、定植速度不一致。而稻谷搖瓶種菌齡一致，培養時間短，不易老化，接種后菌絲萌發好，均勻一致。
　　4、采用兩頭接種或打孔接種的栽培方法，菌袋必須在非無菌環境中培養20-60天，培養料中通常會加入10%-20%的玉米粉，培養料營養豐富，極易感染雜菌。如果先將稻谷培養成菌種，菌種以10%-20%的比率與已滅菌不加玉米粉的培養料混和，再裝袋培養，既不容易長雜菌，又可以大大縮短培養時間。
　　5、常規人工生產食用菌，如平菇、香菇、木耳、金針菇、蘑菇等可以用清水煮熟的稻谷直接制作菌種，特殊食用菌如雞腿菇、松乳菇用人工配制鐵營養液浸煮稻谷也可制作菌種。用稻谷制作菌種統一了食用菌的制種方法，有利于食用菌生產工廠化、機械化的發展。