優良純化的菌種，是食用菌栽培成功的根本保證。現將幾種食用菌母種外觀識別方法介紹如下：
香菇菌絲 在馬鈴薯葡萄糖瓊脂(即PDA)培養基上，菌絲純白色、粗壯，呈絮狀或絨狀，長滿試管后有一定爬壁能力，邊緣呈不規則波曲狀。在24℃左右溫度條件下，菌絲一般12～15天即可長滿試管斜面。具香菇特殊香味。テ焦驕絲 在PDA培養基上，菌絲潔白、濃密、粗壯，菌絲爬壁能力強，可布滿試管空間。在25℃溫度條件下，菌絲一般6天可長滿試管斜面。具平菇特殊香味。
金針菇菌絲 在PDA培養基上，菌絲灰白色，呈絨狀或平貼狀，稍有爬壁現象。菌絲老化后，表面常出現污褐色斑，斜面上常產生粉狀孢子和小子實體。在23℃溫度條件下，菌絲一般10～12天可長滿試管斜面。菇香不明顯。
黑、毛木耳菌絲在PDA培養基上，菌絲初始纖細透明，后漸變為白色粗壯的次級菌絲，呈棉絮狀，叢生密集，菌絲前端較齊短；后期易產生分生孢子，使表層覆蓋有一層粉狀物。菌絲不爬壁，久置見強光后斜面上會出現斑塊膠質體，近似耳片。在28～30℃溫度下，菌絲會分泌深淺不同的色素，毛木耳多為深褐色，黑木耳多為琥珀色(其顏色深淺也與培養時間長短有關)。香味不明顯。
氣生型雙孢蘑菇菌絲 在PDA培養基上，孢子萌發7～9天出現靈芝狀菌斑，菌絲健壯細密，尖端粗直清晰，整齊一致，呈扇形伸展，氣生菌絲似絨毛狀，易在試管中形成菌皮。
銀耳羽狀菌混合菌絲 銀耳菌與羽狀菌按一定比例混合培養后，形成的菌絲短而密，前端整齊。初始期菌絲呈茸毛團狀，生長速度較慢；隨著培養時間的延長，在茸毛團周圍形成一圈緊貼培養基的暈環。
