一、提前做好生產場地排水工作。汛期到來前，清理好生產場所的所有排水溝，以保持排水順暢；同時做好菇棚頂部及周邊遮陽網、電線等設施的檢查及加固工作，防止菇棚倒塌，保證汛期用電安全。
二、及時做好產品采摘和加工。夏季氣溫較高，在暴雨到來前，已出菇的產品要及時采摘和銷售；需要加工干品的應利用晴好天氣，及時將產品進行曬干處理，保證產品質量。
三、雨后及時排水或轉移菌棒。雨后及時清除菇棚內積水，防止洪水浸泡菇床或菌棒（包）。菇棚已垮塌的，要及時轉移菌棒（包），有條件的盡可能轉移到高處。
四、及時修復破損和倒塌菇棚。對因水災損壞倒塌的菇棚要及時采取補救措施，盡快修補或重新搭建，避免災后夏天高溫對食用菌生產造成二次危害。
五、及時清理死菇和爛棒。利用早、晚氣溫稍低時間盡快檢查菌棒（包），發現有爛棒、雜菌感染的必須馬上揀出，集中堆放，不要隨意丟棄，以免相互感染和污染環境。隨時將菇床上受水害浸泡而枯黃的死菇摘除，以免氣溫回升后死菇腐爛引發病蟲害。
六、及時清理消毒生產場所。洪水退后要及時對生產場所進行消毒處理，待天氣轉晴后用石灰粉噴撒一遍，預防病蟲害發生，特別注意防治螨蟲類。對于無法修復的菇棚和無法補救的菌棒（包），要及時清理和消毒生產場所，做好下一造生產的計劃和準備。
七、注意菇棚通風降溫。災后遇到高溫天氣，要密切注意棚內空氣狀況，利用早晚時間掀棚進行強制性通風換氣，降低棚內濕度。棚內空氣要保持新鮮，無霉氣；溫度不能過高，人感覺不悶即可，避免溫度過快上升導致死菇。
八、床栽品種松料補土。雙孢蘑菇等床栽品種要及時松料和補充覆土，以利于排除培養料中的廢氣，使老菌絲斷裂，促進新菌絲長出，形成菌絲強勢，為下一潮出菇打好基礎。松料分大松、中松和小松三種，應根據菌床培養料的實際情況而定。待菌絲生長恢復后，及時向料面噴水，恢復日常管理，促使轉潮出菇。
九、重新利用培養料。培養料質地還較好的爛菌棒（包）可曬干再利用。可將已軟化破爛的菇棒（包）及時脫袋打碎或加1-1.5%石灰、麩皮等堆積，發酵培養料。處理后的培養料可重新用于生產平菇、竹蓀、大杯蕈、雞腿菇或其他品種。
十、注意新生產場所選址建設。準備新建設的生產場所，盡量選擇在地勢較高，排灌方便的位置，建設好排水、引水、噴灌水等設施。菇棚建造要利于調溫調濕，通風能自由調節；可用遮陽網、樹枝、雜草、秸稈等對菇棚進行覆蓋避雨。
