冬季氣溫低，菌絲和子實體生長緩慢，呼吸強度低，出菇量少，但菇肉厚、品質好。廣大菇農要抓住春節期間市場需求量大、冬菇暢銷價高的好時機，果斷采取措施，爭取多出菇，出好菇，取得較好的經濟效益。
具體管理措施有三條：提高菇床溫度，創造長菇條件冬季寒冷，只能靠自然氣溫，結合人為地調節。香菇棚揭去棚上的遮蓋物，菇床上的薄膜除采菇須揭開外，其余時間罩緊;平菇棚把棚上遮蓋物攤稀;蘑菇棚在菇棚的外表再覆蓋一層薄膜。靠自然陽光的照射及菌絲自身的生物熱量來保持菇棚內的溫度，晚上棚外加蓋遮陽網或草簾防凍防霜。一般采取以上措施后，棚內溫度可提高5℃-10℃，在寒冷的冬季仍能正常出菇。
補水控濕，保暖防寒香菇、平菇經發菌和秋菇生長，菌棒失水較多，只有原重的50%-60%，這時應補水。補水前敞開棚門通風3至4天，補水時用注水針刺入菌棒內，借助水泵的壓力，使菌棒在短時間內吸足水分，水源以井水為宜。噴水的原則是：噴霧狀水，菇多時多噴，菇少時少噴，蕾期多噴，采收期少噴。蘑菇冬季基本不需進行補水噴水。
注意通風換氣，避免寒風襲擊菇蕾發生后，呼吸旺盛，如果空氣不流通，二氧化碳沉積過多，就會抑制子實體的形成與生長。通風換氣掌握在氣溫較高的中午前后進行，時間10-20分鐘。進出棚內操作，從棚的南側進出，防止干冷寒風襲擊。
