黑木耳的“流耳”又名“水爛耳”是細胞充水破裂的一種生理障礙現象。木耳流耳病是袋料栽培木耳過程中非常容易感染的一種病蟲害。木耳一旦感染此病，輕則減產，重則絕收，嚴重影響菇農的經濟效益，因此，對木耳流耳病的防治，要引起高度重視。其防治措施有：
1、氣溫高時及時降溫：白天關閉耳棚門窗、窗口懸掛濕簾，噴水降溫，夜間打開門窗通風降溫，盡可能將溫度控制在30攝氏度以內。在這樣的溫度條件下，不僅木耳出耳快，出耳齊，開片好，色澤正，而且線蟲的生長繁殖受到一定的抑制，若溫度超過30攝氏度，則線蟲繁殖加快，容易產生流耳。
2、耳棚場地應有一定坡度，表層土以沙質土壤為好，以便于滲水。
3、水源清潔衛生，以潔凈的深井水作水源最佳。
4、精心管理：木耳在不同的生長階段對溫度、濕度和通風的要求是不同的。在木耳原基形成期，保持相對濕度在80%左右，并適度通風。在原基分化形成期，珊瑚狀耳芽相當幼嫩，此時相對濕度不宜過大，保持在80%-90%即可。在子實體生長階段,為促進耳片快速生長，要堅持干干濕濕的原則（三干七濕），加大通風，相對濕度控制在90%-95%。當子實體耳片充分展開，邊緣變薄，耳根收縮，八分成熟時即開始采收。
5、發生少量流耳時，先清除流耳，再用1%-2%的食鹽水噴灑木耳，同時用5%的石灰水噴灑地面，以控制線蟲、細菌和原生動物的進一步蔓延，然后用磷化鋁密閉熏蒸24小時。
