干燥貯存香菇吸水性強(qiáng)，含水量高時(shí)容易氧化變質(zhì)，也會(huì)發(fā)生霉變。因此，香菇必須干燥后才能進(jìn)行貯存。貯存容器內(nèi)必須放入適量的塊狀石灰或干木炭等吸濕劑，以防返潮。
低溫貯存香菇必須在低溫通風(fēng)處貯存，有條件的可把裝香菇的容器密封后置于冰箱或冷庫(kù)中貯存。
避光貯存光線中的紅外線會(huì)使香菇升溫，紫外線會(huì)引發(fā)光化作用，從而加速香菇變質(zhì)。因此，必須避免在強(qiáng)光下貯存香菇，同時(shí)也要避免用透光材料包裝。
密封貯存氧化反應(yīng)是香菇質(zhì)變的必經(jīng)過(guò)程，如果切斷供氧則可抑制其氧化變質(zhì)。可用鐵罐、陶瓷缸等可密封的容器裝貯香菇，容器應(yīng)內(nèi)襯食品袋。要盡量少開(kāi)容器口，封口時(shí)要排出襯袋內(nèi)的空氣，有條件的可用抽氧充氮袋裝貯。
單獨(dú)貯存香菇具有極強(qiáng)的吸附性，必須單獨(dú)貯存，即裝貯香菇的容器不得混裝其他物品，貯存香菇的庫(kù)房不宜混貯其他物資。另外，不得用有氣味揮發(fā)的容器或吸附有異味的容器裝貯香菇。
