水溫盡可能與菇棚溫度一致，不要用冰涼的水。原基、菇蕾上不要噴水，最好用噴霧器補水，噴嘴朝上向空間噴霧增濕。補水后，如菇體上有水珠應通風去除。

菌袋補水是重要的增產措施，主要用于栽培周期較長的食用菌。需注意：(1)香菇等轉色完成、出菇前就要補水，補到培養料含水量65%左右。(2)多數食用菌在出完一、兩潮菇后轉潮期進行補水，要先養菌，再補水，補水量控制在原菌袋重量的80%-90%為好。(3)菌絲稀疏、長勢弱、溫度低于5℃或料內發生病蟲害時不宜補水。(4)三潮菇后補水時，可同時補充營養物質，常用尿素、糖、磷酸二氫鉀等。