當菌料袋培養5-7天后，要上、下、左、右翻堆一次，以后隔幾天翻動一次，使料溫趨于一致，受光均勻，同時檢查污染情況。開始發現有個別袋有污染時，可采有75%酒精加40%甲醛，注射于污染和培養料交界處，可控制雜菌繼續蔓延，后期發現污染，要及時將污染袋銷毀。

　　二、菌絲成熟階段管理　　

　　香菇菌絲長滿袋后不能立即出菇，只有讓菌絲體繼續分解培養料中的木質素等營養成分，使菌絲達到生理成熟，才具備產生優質香菇子實體的先決條件。當菌絲長滿袋后，可將室溫升高2-3℃　，有利于菌絲體的生理成熟。生理成熟時間長短，除環境條件外，也因品種不同而異。早熟種一般從接種到收獲約需60天，中熟種需80-100天。成熟的主要標志是袋壁四周菌絲體膨脹、皺褶、隆起的腫和松軟感，在接種穴周圍出現微棕褐色等癥狀，則表明已達到生理成熟，菌絲體則由營養生長轉入生殖生長階段。這時可以將菌料袋移到出菇場所脫袋轉色出菇。

　　三、菌料袋脫袋與轉色　　

　　香菇料袋達到生理成熟后，可以排場出菇。先脫出塑料袋，可用雙面刀片或鋒利小刀，將塑料膜輕輕劃破后，小心揭去薄膜，準備場或排架。

　　1、畦架安排和料袋排放：菇場安排在室外，畦寬要注能排放5-8個菌料袋，每袋間有2-3厘米間隙，長度可因地制宜，因菌袋數量而定，以便于管理為原則。若菇場安排在室內，要求架間距2-3厘米。排畦或排架時與料袋夾角成70度至80度為宜。放置好后，要防止失水太多，每排完一畦或一架必須用干凈的塑料膜立即罩起來。如采用地下室出菇，考慮到其保溫性能較好，可以免去每畦罩上塑料膜。

　　2、菌袋轉色管理：香菇轉色因品種對環境條件的求不同而異，轉色最理想的溫度為18-24℃　，因此轉色期一定要控制好溫度。轉色要有充分的散射光，較理想的光照強度是100勒克斯，完全黑暗不能轉色。轉色期的空氣相對溫度以80-90％為宜。

　　菌料筒脫袋后3-5天內，尤其是遇到25℃高溫，應立即罩上塑料膜;5-6天后菌筒上長出一層濃白色菌絲時，可以加大菌筒表面的濕度，增加翻動菌筒次數，多揭幾次塑料膜，以增加菌筒與空氣、光線接觸的機會，使絨毛狀菌絲倒伏并分泌色素，這時菌筒表面形成一層薄薄的棕約色具有光澤的菌膜。在轉色過程中，會出現棕色積水，這是快出現子實體的象征，要立起菌快讓其出菇，并主動讓積水流出，當棕色積水太多時，要加強通風透氣，或用干凈的棉布或脫脂棉擦干積水，以防污染。