金針菇菌渣中含有豐富的有機質和氮磷鉀等養分，可用于有機肥的生產，金針菇菌渣有機肥用于蔬菜種植，增產效果明顯。
　　專家以工廠化金針菇菌渣為原料制備有機肥，開展了菌渣有機肥在油菜上的肥效試驗，結果表明，菌渣有機肥可替代化肥在油菜上做基肥施用，能夠促進油菜增產。
　　生態農業生產中金針菇菌渣有機肥配合化肥使用效果較好，每畝施用菌渣有機肥300kg和25 kg復合肥的處理最佳，比農民習慣施肥增產24.6%，效益提高21.5%。