一、改善生態環境。栽培棚要設在靠近河流、空氣流通、四周寬闊，又遠離畜禽飼養場、釀造廠及居民生活區、醫院（距離至少在3000米以上）的地方。場地采取翻土、日曬、灌水等措施，取代農藥消毒，水源水質要保持清潔無污染，嚴禁用污水噴菇、浸洗。

二、用生物和物理技術防治病蟲鼠害。配制培養料時可采用植物抑毒劑和植物農藥，如紫蘇、除蟲菊、菜子餅，均可制成植物農藥殺蟲、治螨；利用天敵滅害，如養貓治鼠。還可以采用壯菇抑蟲的方法，從菌種選育、培養料配比、堆料發酵、接種發菌、出菇管理各個環節嚴格把關，培育健壯的菇體，增強其抗逆力，減少病蟲害。還可采取特異性菇類間作等方法，如菇、蓀輪作，防治病蟲害。接種室、發酵室、超凈工作臺等，采用30瓦的紫外線燈照射、消毒殺菌；也可采用電子臭氧滅菌器消毒殺菌。菇棚可采用黑光燈誘殺菇蚊、蒼蠅等昆蟲。菇棚的進出口及通風口要安裝防蟲網或紗窗等。

三、科學用藥。在確需使用化學農藥時，必須選用高效、低毒、低殘留的藥劑，如敵百蟲、克螨特、銳勁特、甲基托布津、甲霜靈等。用藥應在沒出菇或每批菇采收后進行，并注意少量、局部使用，嚴禁在菇類生長期間噴灑農藥，禁止使用甲胺磷、甲基1605、1059、久效磷、水胺硫磷、殺蟲脒、氧化樂果、毒殺酚等高毒、高殘留農藥。

四、把好產品加工關。食用菌產品常因加工引起含硫量超標，為此，必須全面推廣精密度高的機械進行脫水烘干。銀耳要采用白色菌株，運用新科技改變銀耳熏磺加工環節，優化產品質量。菇品包裝必須符合國家衛生標準，即符合GB7096—86干食用菌衛生標準、GB7097—86鮮食用菌衛生標準和GB9691—88包裝衛生標準。