香菇、猴頭、木耳等生產實踐中應用二次套袋技術(即在菇筒出灶時加套一層薄膜袋，使袋內菇筒不直接接觸環境空氣)進行生產，可有效解決菌筒生產過程中交叉感染的問題，使菌株成活率保持在97%以上。現將該技術介紹如下：

外袋的準備。外袋宜選用周長大于內袋周長2厘米、長度比內袋長5厘米、厚度為0.2絲的低壓聚乙烯薄膜袋，一頭打結封口待用。

及時套袋。料筒經過高溫滅菌出灶時，邊取出邊用外袋套好，并擰緊袋口搬入培養室，將料筒溫度降至25℃以下。注意：料筒出灶后要迅速裝入外袋，避免其與外界環境接觸時間過長而感染雜菌。

接種操作。接種時，在接種室或接種箱內解開外袋，向封閉一方推動，拉開4/5后進行接種，接種完后馬上套好外袋擰緊放置。

適時脫去外袋。在培養過程中注意培養室溫度，待菌筒菌絲發至80%左右時脫去外層袋，按常規生產方法管理。