【作者】劉旭影 阮心眉 程凡升 李文香 朱丹

【機(jī)構(gòu)】青島農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院 青島農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院

摘要：以雙孢蘑菇(Agaricus bisporus)10448個(gè)蛋白為研究對(duì)象,綜合利用信號(hào)肽分析軟件SignalP 4.1、跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)軟件TMHMM v2.0、GPI錨定位點(diǎn)預(yù)測(cè)軟件big-Pi Predictor以及亞細(xì)胞蛋白定位軟件TargetP1.1等生物信息學(xué)軟件,篩選雙孢蘑菇胞外分泌蛋白質(zhì)序列,使用分析軟件BLAST2GO進(jìn)行功能注釋。篩選得到469個(gè)胞外分泌蛋白質(zhì)序列,統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn)編碼這些蛋白質(zhì)的開放閱讀框(open reading frame,ORF)最長(zhǎng)為4800bp,平均為1233bp。除去假定蛋白質(zhì),雙孢蘑菇胞外分泌蛋白質(zhì)的生物代謝途徑主要有生物大分子代謝(22.2%)、碳水化合物代謝(17.4%)、脂質(zhì)代謝(3.2%)、芳香化合物代謝(2.2%)等。同時(shí),共發(fā)現(xiàn)133種酶類,其中包括糖苷水解酶(38.5%)、多銅氧化酶(7.4%)、肽酶(7.0%)、果膠裂解酶(4.0%)和羧酸酯酶(2.9%)等。 

基金：國(guó)家自然基金(31301438和31501331)； 山東省優(yōu)秀中青年科學(xué)家獎(jiǎng)勵(lì)基金(BS2013SW034)； 山東省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系食用菌創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)建設(shè)專項(xiàng)基金(SDAIT-07-07)資助；

關(guān)鍵詞：雙孢蘑菇; 胞外蛋白; 生物信息學(xué); 功能注釋; 酶學(xué)分類;