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    食(藥)用真菌比較基因組分析揭示其生態特性


    【發布日期】:2019-01-22  【來源】:菌物學報
    【作者】吳冰 章小靈 崔寶凱 戴玉成
    【機構】北京林業大學微生物研究所 中國科學院微生物研究所真菌學國家重點實驗室
    摘要:食(藥)用真菌可以產生多種酶系家族來降解環境中的木質纖維素,從而獲得營養或與植物共生或寄生。通過注釋和比較不同營養模式的食(藥)用真菌中降解木質纖維素的酶類,有利于我們更好地認識食(藥)用真菌的生活模式,并進一步改善培養條件。本文系統地研究了46個食(藥)用真菌和3個降解木質纖維素模式真菌的基因組,根據預測蛋白質組解析了糖苷水解酶(glycoside hydrolases,GHs)、糖基轉移酶(glycosyltransferases,GTs)、多糖裂解酶(polysaccharide lyases,PLs)、碳水化合物酯酶(carbohydrate esterases,CEs)、碳水化合物結合模塊(carbohydrate-binding modules,CBMs)以及附屬活力酶(auxiliary activities,AAs)和細胞色素P450(cytochromes P450)的種類分布。比較基因組學結果顯示,食(藥)用真菌中降解木質纖維素相關酶系家族的數量和種類差別很大,同時酶系家族的多樣性與食(藥)用真菌的生態類型也有一定的相關性。一般情況下,腐生營養真菌比共生營養真菌中降解木質纖維素酶類更多,而腐生營養中的白腐真菌和草腐真菌的酶系比褐腐真菌多。
    基金:國家重點基礎研究發展計劃(973計劃)課題(2014CB138301);
    關鍵詞:食用菌; 藥用菌; 木質纖維素; 木質素;
     
     
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