目前，荷蘭的食用菌正遭遇到一系列嚴重的質量問題。這些質量問題主要是細菌污染和含水量過大，結果導致產品貨架期縮短。

有關專家指出，目前用來生產雙孢蘑菇的堆肥質量較差，堆肥中殘存霉菌是導致品質下降的主要原因。此外，食用菌栽培場所的高溫、高濕環境是另一個影響品質的因素。

目前，荷蘭新鮮雙孢蘑菇的貨架期為2天，比正常情況下要短一些。荷蘭許多超市為此抱怨不已。

針對上述情況，荷蘭的雙孢蘑菇生產者采取的唯一應對措施是延緩采收時間。原來雙孢蘑菇成熟17天后就采收，現在則延至第20天后采收。這樣做的結果是產量有所下降，但質量卻提高不少。