一、 菌種制作的基本設備。
1、食用菌菌種制作的工藝流程：
培養料的貯備和預處理------- 容器、工具的洗滌------ 配料、培養基制作------ 滅菌------ 冷卻------ 接種------ 培養------- 貯存
2、基本設施：
① 廠房：② 原料庫③原料預處理場地④ 洗滌室：5配料室⑥ 滅菌室⑦ 接種室⑧ 化驗室 ⑨ 培養室⑩貯存室
二、純種分離。
菌種的分離方法主要有：孢子分離法、組織分離法、基內菌絲分離法和土中菌絲分離法。
（１） 種菇的選擇和處理 種菇選擇的標準：必須純正，具有本菌株性狀，發育健壯，無病蟲害，成熟度適當。種菇選定后，首先除去附著在菇體表面的雜物，如蘑菇、草菇可用0.1%升汞浸泡消毒2-3分鐘，然后用無菌水漂洗3次，以洗除表面附著的藥物，最后用無菌紗布吸干水分。香菇、平菇可用75%酒精進行表面消毒。
（2）多孢分離法 ① 整菇播種法② 鉤懸法③ 貼附法 4菌褶上抹取孢子法⑤ 孢子印分離法 ⑥ 空中孢子捕捉法。
（3）單孢子分離法：一般采用方法：平板稀釋法、連續稀釋法、毛細管法等。
2、組織分離法：
（1）子實體分離法。
（2）菌核分離法。
（3）菌索分離法：對一些不易找到子實體及菌核的菌類。
3、基內菌絲分離法 對于子實體只有在特定的季節下出現，平時不易采到，或子實體小而薄或呈膠質狀態。
（1）菇木（或耳木）分離法 在食用菌繁殖旺盛期。
（2）代料基質分離法 分離前，選擇一批子實體發生早、產量高、菇體尚幼嫩且生活力強而無病蟲害的栽培袋，待子實體將近成熟時，去掉子實體，然后用75%酒精將培養袋進行消毒后，在培養料下1.5cm處挑取0.3cm的培養料小方塊組織，接入試管培養基的中央，置于恒溫下培養。
3、土中菌絲分離法： 用于采集生長在土中的菇類菌絲體 三、制種技術 采用孢子分離、組織分離和基內菌絲分離等方法分離培養而獲得的純菌絲，經過原種的擴大培養和母種、栽培種的制作，即可作為食用菌生產用的菌種。
1、菌種的類型：母種、原種、生產種。
2、培養基的種類 天然培養基、合成培養基、半合成培養基。
3、原種制作 從擔孢子或菇體組織直接分離培養獲得的原種或引進的原種。
4、母種及生產種制作 將原種菌絲體移植到由糞、草、木屑、棉籽殼或麥粒等原料配制成的培養基上，而制成的菌種稱母種。將母種再擴大繁殖制成的菌種，稱栽培種或生產種。
5、培養基滅菌：
（1）高壓蒸汽滅菌法 瓊脂培養基采用1.05kg/cm2 壓力，溫度121℃ ，滅菌45-60分鐘；母種和栽培種固體培養基采用1.2-1.5kg/cm2 壓力，溫度123-129℃ ，滅菌1-1.5 小時。
（2） 常壓蒸汽滅菌。
