1．出現群菇 播種量過大，播種不均勻，會導致出現群菇。所以，播種量宜控制在0．2～0．3千克／平方米。
播種方法可采用層播、混播或撒播，最好不用穴播。
2．菌種老化 若是使用了老化的菌種，雖菌絲的萌發和定植都正常，第一潮菇產量也不錯。但第二、三潮菇產量明顯降低，總體產量降低。因此，購買菌種時，必須注意。
3．溫差過大導致小菇蕾死亡 草菇在子實體發生期間，通風和噴水管理，都必須使栽培環境盡量維持恒溫，通風只能緩緩進行，并且密切注意氣候的突然變化，大風天嚴禁開窗通風。噴水時也要注意使用的水溫與室溫一致。
4．培養料酸化 酸化的培養料，菌絲生長稀弱無力，無光澤感，子實體發生既少又小，且易破膜開傘。同時鬼傘卻大量發生。防止酸化的方法，除在配制培養料時注意調整好pH值之外，還應將播種后的水分管理，改為噴0．5％石灰水。
5．蹋料 過松的培養料，蹋料現象嚴重，造成菌絲斷裂，培養料變薄，出菇量減少。所以在上床和播種后，一定要注意將培養料略為壓實。若是堆垛法栽培．堆形宜低不宜高。
6．病蟲害 使用變質原料或培養料發酵、消毒等預處理不徹底，或在不衛生的場所栽培，皆可導致雜菌和害蟲大量滋生。使床面幼菇大量死亡、僵化腐爛或致畸。
