1、低溫貯藏法
（1） 常溫保鮮
采收后的新鮮金針菇經整理后，立即放入筐、籃中。其上覆蓋多層濕紗布或塑料薄膜，置于冷涼處（自然氣溫20℃以下），一般可保鮮1-2天。
（2） 簡易包裝后低溫保藏
新采收的金針菇經整理后，用低密度聚乙烯薄膜袋（DpE）袋膜厚20毫米，分裝，抽真空封口，將包裝袋豎立放入專用筐或紙箱內，1-3℃低溫冷藏。可保鮮13天左右。
2、化學保鮮法
采用對人畜安全，無毒的化學物質用于浸泡或噴灑在金針菇表面，以達到延長金針菇新鮮的目的。可用于金針菇保鮮的化學物質有：焦亞硫酸鈉、氯化納、稀鹽酸、高濃度的二氧化碳、保鮮劑、抗壞血酸及比久等。
（1） 焦亞硫酸鈉噴灑保鮮：用0.02%焦亞硫酸鈉溶液漂洗金針菇以除去泥沙碎屑，再用0.05%焦亞硫酸鈉溶液浸泡10分鐘護色，撈出瀝干后分裝塑料袋中可保鮮數天。
（2） 氯化納（即食鹽）、氯化鈣液保鮮：0.2%食鹽液加0.1%氯化鈣制成混合浸泡液，將剛采收整理好的金針菇浸泡上述混合液中，要求菇體浸入液面以下30分鐘，撈出瀝干分裝塑料袋中，可保鮮數天。
