一、結束出菇。冬季播種的平菇、金針菇、杏鮑菇等結束出菇后，應予清理菇棚，整理衛生，有針對性地噴施藥物防治病蟲害。菇農可使用百病傻200-500倍液和200-400倍液賽百09交替噴施，在達到預期目的的基礎上，最大限度地防止病原菌產生抗藥性。
對于害蟲，推薦使用低毒、低殘留、高效的菊酯類藥物，如氯氰菊酯等，絕對禁止有機磷類化學藥物進入生產的任何環節。
二、正在出菇。春季播種的如平菇、姬菇、黑木耳、毛木耳、靈芝等，已進入出菇高峰或正在陸續出菇，應在“預防為主，防治兼顧”原則指導下加強病蟲害防治。關鍵點有二：一是選擇低毒、高效、無殘留或低殘留的藥物，絕對不得使任何藥物黏附到子實體上；二是提前準備好食用菌(木耳類)晾曬的設施，如曬網、曬臺等，并注意衛生。
三、即將出菇。根據各地市場的供求差異而安排不同時段出菇，是生產者必須考慮的問題。應“拉開時間、錯開季節”的食用菌生產安排，如6月份，常規平菇、姬菇大量上市，他們便安排在7月份以后再行生產，即可錯開常規的應市高峰，而在常規二三潮時段拿出第一潮菇品，以贏得市場并保持較高價位。該類生產的關鍵點是，在按正在出菇階段管理的同時，最好是配備控溫設施，以便自主掌控出菇時間。
為避免出菇期出現的營養不足而影響出菇的情況發生，菇農一定要科學調配基料。實踐證明，大多基料配方中缺乏大量的營養元素，尤其是中微量元素的缺失，使得菌絲生長不健壯、抗性下降，污染率、發病率上升。
可每250公斤原料中，加入120克食用菌三維營養精素(拌料型)補充營養。培養室、出菇棚要徹底消毒殺菌。
