銹斑病是由假單孢菌引起的病害。感病金針菇的菌蓋產生有銹色斑點，主要是浸染金針菇菌蓋。初期為針頭狀，后擴大成芝麻粒大小，邊緣雖不整齊，但病斑之間可互相聯合成不規則的大銹斑。該病的病原菌存在于培養料及漂浮在空氣中，在高溫高濕、通風不良等條件下銹斑病最易發生。
防治方法：為預防銹斑病的發生，對菇房灑水時不要直接灑向子實體，以防止料面出現積水。灑水后應及時通風，室內的空氣相對濕度不要長時間超過95％，菌袋表面覆蓋地膜時要待子實體水分晾干后。發病初期，應防止病菌向健康子實體蔓延，并用50％的多菌靈800倍液或每毫升含100～200單位的農用鏈霉素噴灑。
