在栽培平菇過程中，環境條件及管理方法不妥；造成反常的生理活動的現象。我們稱為生理性病害。
菌絲瘋長：菌絲表層氣生菌絲濃密，影響出菇。形成菌絲瘋長的原因主要是空氣濕度大，通風不良所致。防止辦法，加強通風，降低濕度即可。
平菇的大腳菇：子實體菌蓋極小，菌柄粗長。這主要是缺氧、通風不良造成的。只要加強通風，注意光線即可防止。
平菇枯萎：菇蕾或子實體生長停滯，逐步萎縮、變干枯死、腐爛。發生的原因主要是水分不足，通風過大。防止辦法，增加空氣相對濕度，不使料面干燥，通風時切勿讓風直吹菇蕾或子實體。
平菇藥害：子實體噴藥后（敵敵畏），菌蓋停止生長，邊緣形成一條黑邊、翻卷。要禁止使用一些有害的農藥。
銹斑：平菇菌蓋、菌柄上產生銹褐色斑點。發生的原因，主要是通風不良、濕度過大形成的。防止辦法，加強通風，降低濕度。
