杏鮑菇菌棒感染嚴重的原因主要有：1.原料里面摻了被雜菌感染的原料。2.滅菌時間不足，滅菌過程中出現停火斷氣。3.滅菌灶內菌袋擺放過多過緊。4.原料選用木屑、玉米芯等質地較硬的培養料時料沒有吸透水，料內有生心，容易出現滅菌不徹底。5.在用壓力鍋滅菌時沒有排盡冷空氣，導致滅菌不徹底。
1.原料要選用新鮮、無霉變的原料，不能填加任何霉變原料。2.在水開后要大火持續滅菌10～12小時。3.滅菌灶內的菌棒排與排之間、排與墻壁之間留1厘米左右的空間。4.用玉米芯、木屑等質地堅硬原料做栽培料時在拌料之前要提前用水浸泡到料內無白心。5.壓力鍋滅菌時必須在壓力達到0.05MPa時打開排氣閥，充分排盡冷空氣后再關閉排氣閥滅菌。
關于杏鮑菇比較小的原因，首先跟品種有關系。現在主栽的品種主要分為棍棒狀和保齡球狀。保齡球狀品種則長成的成品菇本身個體就比較小；如果品種是棍棒狀的，但個體較小，很可能是沒有進行疏菇蕾措施導致的。也就是說，杏鮑菇在原基分化后，在菌袋兩側長出很多菇蕾，但由于營養和空間的限制，這些菇雷大部分不能長成商品菇，所以必須進行疏蕾。具體來說要在子實體長至1.5厘米左右時，選位置好、菇形正的菇蕾并保留2個，其余的都要進行疏除。
