危害食用菌的毛霉種類很多，最常見的為總狀毛霉（Mucor racemosus）、大毛霉（M.muccedo），俗稱長毛菌，其在高溫、高濕度以及通風不良的條件下生長良好。毛霉菌可污染平菇、蘑菇、香菇、草菇等多種食用菌菌種。
　　危害癥狀
　　一旦受毛霉感染，在培養基表面形成灰白色菌絲，因菌絲長生速度極快，不幾天就占領了食用菌生長所需要的整個空間，到后期在菌絲表面形成許多圓形黑色小顆粒體。栽培袋被污染后，培養料上長出粗糙、疏松發達的營養菌絲，初期為白色，后變為灰色、棕色或黑色，條件適宜時，不到一星期在培養料內外布滿了毛霉菌菌絲，使料袋變黑，導致料面不能出菇。
　　形態特征
　　菌絲體發達，分枝，無隔膜，呈棉絮狀。無性繁殖產生孢囊孢子，孢囊孢子橢圓形，淡黃色，單胞。有性繁殖產生接合孢子。
　　發生規律
　　毛霉在稻草、堆肥以及植物殘體上均可生存，孢子成熟后隨空氣氣流飄散傳播，培養料、接種室等消毒不徹底或不嚴格按無菌操作規程接種制種，均有被毛霉污染的可能。基質表面只要濕度合適，孢子就能萌發生長出菌絲，在高溫高濕條件下成長快、蔓延迅速。菌種被感染，成品率降低；茹床上發病，產量受到嚴重影響。
　　防治方法
　　注意搞好環境衛生，保持培養室周圍及栽培地清潔，及時處理廢料。接種室、菇房要按規定清潔消毒；制種時操作人員必須保證滅菌徹底，袋裝菌種在搬運等過程中要輕拿輕放，嚴防塑料袋破裂；經常檢查，發現菌種受污染應及時剔除，決不播種帶病菌種。如在菇床培養料上發生毛霉，可及時通風干燥，控制室溫在20～22℃，待雜菌抑制后再恢復常規管理。調節pH，適當提高pH，在拌料時加1%～3%的生石灰或噴2%的石灰水可抑制雜菌生長。藥劑拌料，用干料重量0.1%的甲基托布津拌料，防治效果更好。