在菌蓋中孢子散發后,菌蓋由軟變硬,沒有淺白色邊緣,顏色由淡黃轉成紅褐色,不再生長增厚時,即可采收成熟的靈芝。采收后及時陰干即為靈芝成品。靈芝采收后,段木還可繼續再用。只要清除段木上的污物及不能形成菌蓋的小子實體,再噴足水分,在適宜的條件下,5～7天又可長出芝蕾,一直可以采收到11月份,一般直徑20厘米以上的段木,可連續采收2～3年。每100千克段木一年可收1.5千克左右靈芝干品。以身干、菌蓋肥厚、菌柄粗壯、質堅硬、色紅褐、具漆樣光澤者為佳。