香菇、猴頭菇、木耳等應用二次套袋技術（即在菇筒出灶時加套一層薄膜袋，使袋內菇筒不直接接觸環境空氣），可有效地解決菌筒在生產過程中交叉感染的問題，菌株成活率能保持在９７％以上。現將該技術介紹如下：　　
       外袋的準備 外袋宜選用周長大于內袋周長２厘米、長度比內袋長５厘米的低壓聚乙烯薄膜袋，一頭打結封口待用。　　
       及時套袋 料筒經過高溫滅菌出灶時，邊取出邊用外袋套好，并擰緊袋口搬入培養室，將料筒溫度降至２５℃以下。要注意的是，料筒出灶后應迅速裝入外袋，避免其與外界環境接觸時間過長而感染雜菌。　　
       接種操作 接種時，在接種室或接種箱內解開外袋，向封閉一方推動，拉開４／５后進行接種，接種完后馬上套好外袋擰緊放置。　　　適時脫去外袋 在培養過程中要注意培養室的溫度，待菌筒內的菌絲發至８０％左右時脫去外層袋，按常規生產方法管理。