蘑菇是糞草型腐生菌。在長期人工栽培的實踐中，人們發現蘑菇對營養物的適應性很強，很多物料都可作為蘑菇的栽培材料。每種物料的養分、營養的可給性和分解速度有差異，使用時只要合理配搭好，能得到很好的效果。
選擇培養料
一、畜糞類：牛糞、馬糞、豬糞、羊糞、雞糞、鴨糞、白鴿糞等，都可以用于栽培蘑菇。其中馬糞、牛糞最合適，其次是羊糞。其他的幾種禽畜糞由于含草纖維少，拌有撒落的飼料等因素，含氮較多，易產生氨，要經曬干后才拌入培養料中配搭使用，這類物質養分持效期長。糞類物在培養料中可占６０％－７０％比例。
二、草秸類：麥稈、稻草、牧草等物料養分充足，纖維質豐富，易分解，蘑菇菌絲體易吸收，一般可占培養料２５％－３０％的比例。
三、富含纖維素類物料：棉籽殼、破籽棉、豆秸、玉米稈、高粱稈等也是纖維素豐富的物料，可代替草料使用。堆制培養料或栽培時，應特別注意水分的調控。
四、含氮漚制類物料：酒糟、豆餅、花生餅等含氮素很豐富，使用時注意用量，一般用５％－１０％為宜，而且要經過特別的漚制才好使用。
五、其他物料：尿素、硫銨、過磷酸鈣、碳酸鈣、石膏等一般使用２％－３％為宜。過磷酸鈣幾乎與不同的物料配搭都用得上。石膏、碳酸鈣也很普遍使用。培養料中糞類物料多，則不宜采用尿素、硫銨、豆餅等，而以草秸物為主的培養料，可適當增加這類物料。
堆制發酵
選擇靠近菇房、地面平整，最好是水泥地板的場地進行培養料堆制。把草料切成約２０公分長的小段或不切。用清水或尿水浸泡１－２天，濾去水分，含水量約７０％。干糞物也要預濕，方法是酒水在干糞上堆起來。
建堆時第一層在地面鋪一層１２－１５公分厚預浸過的草料，接著鋪上一層４－６公分厚預濕的糞類。如此反復交替堆積至８－９層。整個料堆高約１．５米，寬１．８－２．２米，整個堆要求上窄下寬，頂部龜背形。堆制過程中，把尿素、硫銨等物料溶于水，從第三層開始輕輕酒入。按“底層不酒水、中層少酒水、上層酒透水”原則進行酒水至堆料四周有水滲出為宜。堆成后用草簾蓋好，避免風吹日曬雨淋。建堆后第二天開始升溫，至第四天溫度升至攝氏７０度，可以看到料下沉，堆上有熱氣升起。
至第５－７天溫度下降，可進行第一次翻堆，盡量做到把原來堆外表的料翻入堆內，底層的翻上頂面。四天后第二次翻堆，再過四天第三次翻堆，這次翻堆可拌入過磷酸鈣、碳酸鈣或石膏，調節酸堿度，并檢查料的含水量，適當補充水分。以后每隔四天翻堆一次，第五次翻堆時可配合噴酒殺蟲劑，并檢查料的氣味、顏色、料的軟化程度、含水量等，即完成培養料的前發酵工作。每次翻堆的間隔時間因天氣而定，溫度高時可３－４天翻堆一次，氣溫低時可５－７天翻堆一次。
蘑菇培養料堆制中，有時會出現一些不正常的情況，而影響培養料的質量。
１、料溫不能升高：可能是糞類太多，堆料壓得過緊，造成厭氣發酵。２、堆料溫度不能升到技術指標的要求：可能是草料過多，堆料太松散，水分不足。３、堆料翻開有白色粉狀物：可能是堆料溫度過高，而且水分不足，高溫性的放線菌大量生長，大量消耗堆料養分。處理辦法是翻堆補充水分。４、堆料發黑，手感粘糊，有臭味：可能是糞類過多，過濕，透氣性差所致。５、草料腐爛，糞塊夾生，有霉味：可能是預浸時處理不妥，草料過分浸泡，且含水量過大。糞塊浸泡不透。再加上前幾次翻堆不妥，料溫不能升高。
二次發酵
蘑菇培養料的二次發酵，也叫后發酵，是在第一次發酵，即培養料堆制或前發酵的基礎上進行的。二次發酵可以在室內進行，也可以在室外進行。
室內培養料的二次發酵可以在第一次發酵的第三次翻堆后的第２－３天進行，趁著料溫回升時把料送入菇房床架上攤平成２０－２５公分厚。或第一次發酵的第五次翻堆后第５－６天進房。培養料進房后，封密門窗，不能泄氣。加熱源，可以是熱蒸汽、電源、燒煤炭等。把室溫在８－１２小時內，升到攝氏６０－６５度，保持４－６小時。然后降溫至攝氏５０－５２度，保持４－５天。待溫度降至攝氏２５－２７度即可播種。
室外培養料第二次發酵是在第一次發酵結束后，趁著料溫未降時重新建堆。建堆前在堆底開－條通氣溝。堆好后用草簾蓋好。夜間及雨天用塑料膜覆蓋，其內用竹枝撐起約２０公分距離。建堆后第二天料溫應升至攝氏６０度，保持４－６小時，然后掀起覆蓋物降溫至攝氏５０－５２度，這時候要用插棒插一些５公分深的小孔，加強透氣。如此保持４－５天，趁著料溫未降時及時進房。
不過，對蘑菇培養料進行二次發酵時要注意幾個問題：
１、進行二次發酵的培養料無論是室內或室外進行，都要趁第一次發酵的料溫未降時趕快進行。
２、第二次發酵后經過升溫，水分有蒸發散失。發酵后要適當補充水分，補充的水溫要與料溫－致為好。
３、第二次發酵時間一般４－５天，時間不宜過長。及時進房。
４、室內進行第二次發酵的，播種前一定要做好室內的換氣工作。
５、室外進行第二次發酵的，要保證堆溫按時提升或降低，加強透氣，培養料質量才有保證。
經過第二次發酵的培養料進一步熟化，促使大量有益微生物生長發育，促進養分分解和有效養分的積累，并殺滅培養料中的害蟲及有害微生物，使蘑菇菌種的菌絲體在最短時間內適應營養環境，順利生長發育。
優質的培養料應該是質地松軟亮澤，糞料松散軟綿，變成灰褐色，但不是黑色，無結塊，無氨味，無糞臭味，無酸腐味，無霉味。草料柔潤有韌性，成條狀，用力可拉斷。用指甲刮草條，表皮易脫離但不斷，無臭味而有草香味，不霉爛、黃褐色。用手捏培養料指間有水滲出，成團，不粘糊，松手可散開。酸堿度６．８－７．２。最后一次翻堆后的第五天仍有攝氏５０度以上，但不超過攝氏６０度。堆的體積縮小了４０％左右，料的重量減少了３０％左右，含水量大約６５％為宜。
