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    草菇ras啟動子區域的克隆及其序列分析


    【發布日期】:2010-05-15

    劉世強; 楊麗卿; 郭麗瓊; 林俊芳
    中國熱帶農業科學院熱帶作物生物技術國家重點實驗室; 中國熱帶農業科學院熱帶作物生物技術國家重點實驗室; 中國熱帶農業科學院熱帶作物生物技術國家重點實驗室; 中國熱帶農業科學院熱帶作物生物技術國家重點實驗室 ???71701 ; ???71701 ; 海口571701; 華南農業大學食品學院生物工程系; 廣州510640 ; ???71701; 華南農業大學食品學院生物工程系; 廣州510640

    【中文摘要】 根據KajiwaraS[1]等報道的ras啟動子的序列設計并合成一對特異引物,以草菇菌絲的總DNA為模板,通過PCR擴增,獲得一條長約0.75kb片段。DNA序列測定結果表明,該片段長度為751bp。采用Blast軟件和Promoterpredictions軟件進行啟動子序列結構分析,結果表明,該片段中243~293bp和539~589bp兩區域為ras啟動子的基礎啟動子區。在283bp和579bp處有兩個轉錄起始位點,在244~247bp和292~295bp之間有2個TATAbox,在36~39bp、377~380bp、434~437bp和716~719bp之間有4個CAATbox。此外,該片段中還含有9個Gbox、12個Ibox、2個Pbox以及3個重要順式作用元件:ABRE元件、WUN motif(基元)和HSE元件。

    【英文摘要】 A ras promoter region about 0.75kb was cloned by PCR amplification with the primers designed according to the ras promoter sequence reported by Kajiwara S and template of genomic DNA from mycelium of Volvariella volvacea. DNA sequence determination results showed that the fragment length was 751bp. Sequence analysis with Blast software and Promoter predictions software indicated that the fragment contained two basic regions of ras promoter at the regions of 243~293bp and 539~589bp and two transcripted-originated sites at the regions of 283bp and 579bp, two TATA boxes at the regions of 244~247bp and 292~295bp, four CAAT boxes at the regions of 36~39bp,377~380bp,434~437bp and 716~719bp, and that it also contained nine G boxes, twelve I boxes, two P boxes, three important cis-acting elements: ABRE element, WUN-motif and HSE element which were different from the ras sequence from Lentinus edodes.

    【中文關鍵詞】 草菇; ras啟動子; PCR擴增; 序列分析
    【英文關鍵詞】 Volvariella volvacea; ras promoter; PCR amplification; Sequence analysis
    【基金】國家自然科學基金資助項目(30060054和30371000);; 廣東省自然科學基金資助項目(032239);; 華南農業大學校長基金項目(5100-k03003)的部分研究內容

    【文獻出處】 食用菌學報,Acta Edulis Fungi,編輯部郵箱,2004年01期 【DOI】CNKI:SUN:SYJB.0.2004-01-001

     
     
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