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    廣葉繡球菌DASH型隱花色素同源基因Slcry1的序列與表達分析


    【發布日期】:2019-01-27  【來源】:食用菌學報
    【作者】楊馳 馬璐 肖冬來 應正河 江曉凌 林衍銓
    【機構】福建省農業科學院食用菌研究所 特色食用菌繁育與栽培國家地方聯合工程研究中心
    摘要:用關鍵詞"DNA photolyase (pfam 00875)"和"FAD binding domain of DNA photolyase (pfam03441)"搜索廣葉繡球菌(Sparassis latifolia)閩繡1號菌株基因組,找到一個候選基因——隱花色素同源基因Slcry1,PCR擴增得到該同源基因cDNA全長1755 bp,基因組全長為2279 bp;利用PROTPARAM預測SlCRY1蛋白含有584個氨基酸,相對分子質量為65800,等電點為8.94;利用SMART和Pfam預測其保守結構域,發現SlCRY1蛋白(584個氨基酸)包含一個DNA光解酶(DNA Photolyase)結構域和一個FAD結合(FAD binding)結構域;用MEGA7軟件中的鄰位相連法構建系統發育樹,發現SlCRY1屬于光解酶/隱花色素蛋白家族中的DASH(Drosophila,Arabidopsis,Synechocystis,and Homo species)型隱花色素;最后用熒光定量PCR檢測該同源基因在廣葉繡球菌不同發育階段及光照處理下的表達量:在約300 lx白色LED光照下,基因Slcry1表達量隨光照時間延長而增加;不同發育時期,Slcry1基因的表達水平為子實體>原基>菌絲。實驗結果揭示:SlCRY1屬于DASH型隱花色素,其表達量受到光照的誘導,且隨廣葉繡球菌的生長發育而上升。 
    基金:福建省公益類科研院所專項(2016R1019-4); 福建省農業科學院科技創新團隊PI項目(2016PI-44); 福建省農業科學院科技創新團隊(STIT2017-1-6);
    關鍵詞:廣葉繡球菌; 隱花色素; Slcry1; 食藥用菌;
     
     
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