【作者】龔明 鮑大鵬 唐傳紅 張勁松

【機構(gòu)】上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所農(nóng)業(yè)部南方食用菌資源利用重點實驗室國家食用菌工程技術(shù)研究中心國家食用菌加工技術(shù)研發(fā)分中心 上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點開放實驗室

摘要：對"滬農(nóng)靈芝1號"(簡稱滬靈芝)(Ganoderma lucidum SH)等10個代表性的擔(dān)子菌物種進行全基因組次級代謝物(secondary metabolite,SM)簇分析,結(jié)果顯示滬靈芝聚酮合酶(polyketide synthases,PKS)的骨架基因以及SM簇的數(shù)量分別為5和3,高于其它物種,并且都位于支架的末端。通過生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),PKS7和9的SM簇只在滬靈芝中分布;只有PKS7的SM簇(PKS7簇)的骨架基因具有完整的I型PKS功能模塊;只有PKS7簇的骨架基因具有單拷貝直系同源性;PKS7簇的功能注釋基因在不飽和脂肪酸生物合成通路中富集。這些結(jié)果表明PKS7簇為滬靈芝特異性的SM簇,可能代表了滬靈芝抗逆性強的分子特征。 

基金：國家自然科學(xué)基金(31401933)； 上海市農(nóng)委[滬農(nóng)科攻字(2014)第7-1-7號]項目； 上海市農(nóng)科發(fā)[2013(10)]項目資助；

關(guān)鍵詞：靈芝; 比較基因組分析; 次級代謝; PKS; 通路富集分析;