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    南方靈芝中一種新型免疫調節蛋白的生物信息學分析


    【發布日期】:2019-01-26  【來源】:食用菌學報
    【作者】王瑩 高英女 汪瀅 李燕 唐利 華白睿 鮑大鵬
    【機構】國家食用菌工程技術研究中心農業部南方食用菌資源利用重點實驗室上海市農業遺傳育種重點開放實驗室 上海市農業科學院食用菌研究所 上海海洋大學食品學院
    摘要:利用生物信息學方法從蛋白質基本理化特性、信號肽和亞細胞定位、分子進化與翻譯后修飾位點以及蛋白質三維結構等方面,對南方靈芝(Ganoderma australe)中免疫調節蛋白c13717進行預測分析,并將c13717蛋白的分析結果與三種典型的真菌免疫調節蛋白(LZ-8、Fip-fve和Fip-vvo)以及牛樟芝(Antrodia camphorata)中免疫調節蛋白ACA進行比較分析。結果發現,c13717蛋白相對分子質量為14150,N端具有信號肽,亞細胞定位于細胞外,遺傳進化與ACA相近,而與LZ-8、Fip-fve和Fip-vvo較遠,翻譯后修飾位點較少,蛋白三維結構含有cerato-platanin(CP)結構域,不具有真菌免疫調節蛋白典型的FNIII結構,證明c13717蛋白不屬于真菌免疫調節蛋白(fungal immunomodulatory protein,FIP)家族,而屬于CP蛋白家族,可能具有獨特的生物活性。
    基金:上海市農口青年人才成長計劃[滬農青字(2015)第1-11號]、上海市農口青年人才成長計劃[滬農青字(2015)第1-10號]項目資助;
    關鍵詞:南方靈芝; 理論預測; 結構特征; 免疫調節蛋白;

     
     
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