【作者】吳小梅張昕李南羿

【機(jī)構(gòu)】浙江農(nóng)林大學(xué)林業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院浙江農(nóng)林大學(xué)農(nóng)業(yè)與食品科學(xué)學(xué)院

【摘要】雙孢蘑菇是世界第一大宗栽培食用菌,具有重要經(jīng)濟(jì)價(jià)值。為探討雙孢蘑菇子實(shí)體不同發(fā)育時(shí)期基因表達(dá)變化,利用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)雙孢蘑菇原基期、采收期和開(kāi)傘后期等不同發(fā)育時(shí)期進(jìn)行RNA‐Seq分析,共篩選到6 328個(gè)差異表達(dá)基因,其中3 941個(gè)上調(diào)基因,2 387個(gè)下調(diào)基因。Gene ontology(GO)功能聚類分析表明,差異表達(dá)基因主要富集在結(jié)合、催化分子功能組和代謝過(guò)程生物學(xué)通路中,且發(fā)育過(guò)程和有性繁殖相關(guān)的基因全部為上調(diào)表達(dá),以利于細(xì)胞分化發(fā)育形成成熟子實(shí)體進(jìn)入生殖生長(zhǎng)階段。KEGG功能富集分析結(jié)果表明,差異基因參與了氨基酸代謝、碳水化合物代謝、核苷酸代謝、脂類代謝和能量代謝這五大代謝通路,其中差異基因主要富集在氨基酸代謝通路中,氨基酸合成相關(guān)的多數(shù)基因上調(diào)表達(dá),表明雙孢蘑菇子實(shí)體發(fā)育形成需要一系列代謝反應(yīng)協(xié)同調(diào)控,氨基酸代謝相關(guān)基因可能在雙孢蘑菇子實(shí)體發(fā)育過(guò)程中起重要作用。本文通過(guò)全面分析雙孢蘑菇子實(shí)體發(fā)育時(shí)期基因表達(dá)變化,獲得了大量轉(zhuǎn)錄本信息,為深入了解雙孢蘑菇子實(shí)體發(fā)育調(diào)控分子機(jī)理和相關(guān)功能基因提供了重要的基因數(shù)據(jù)資源。 

【基金】國(guó)家自然科學(xué)基金(31201668)； 浙江省農(nóng)業(yè)新品種選育重大專項(xiàng)(2012C12911,2016C02057‐4)~~；

【關(guān)鍵詞】雙孢蘑菇; 高通量測(cè)序; 差異表達(dá)基因; 代謝途徑分析; 氨基酸代謝;